CCDC98阻害剤は、DNA損傷応答および修復経路において重要なCCDC98の機能を調節する能力を有する化合物によって定義される。CCDC98の直接的な阻害は十分に解明されていないため、このクラスの阻害剤は、CCDC98が関与することが知られている細胞プロセスを阻害することに焦点を当てる。これらのプロセスは、主に相同組換えを介したDNA二本鎖切断の修復に関与しており、高度に組織化され制御された細胞メカニズムである。
阻害剤は、CCDC98がBRCA1などの他のタンパク質と形成する複合体の形成や安定化を阻害することによって、あるいはDNA損傷部位へのこの複合体のリクルートを阻害することによって作用する可能性がある。PARP阻害剤のように一本鎖切断の修復を妨げる化合物は、本来CCDC98が修復を助けるはずの二本鎖切断を蓄積させる可能性がある。シスプラチンやエトポシドのようなDNA損傷剤は、修復経路への要求を悪化させ、CCDC98を介する反応に過負荷をかけ、間接的にその機能を阻害する可能性がある。この化学クラスの阻害剤は、その構造もCCDC98に影響を与えるメカニズムも多様であるが、CCDC98が重要な構成要素である経路に影響を与えるという共通の特徴がある。これらの化合物はDNA損傷に対する細胞応答を変化させることができ、DNA損傷の生成によって損傷を増大させるか、あるいはそのような損傷の修復を阻害することによって、ゲノムの安定性を維持するCCDC98の役割に間接的に影響を与える。
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