CCDC63阻害剤には、様々な細胞内プロセスやシグナル伝達経路への作用を通じて、間接的にその機能的活性に影響を与えることができる多様な化合物が含まれる。例えば、Brefeldin AとMonensinはゴルジ体の機能と維持を破壊することが知られており、CCDC63の誤局在化や不適切な翻訳後修飾を引き起こし、その機能を損なう可能性がある。同様に、細胞周期の進行を停止させることが知られているパクリタキセルやノコダゾールのような微小管標的薬も、細胞周期の合図や微小管の動態に依存している場合には、間接的にCCDC63の機能を阻害する可能性がある。
さらに、細胞周期の進行を阻止するパルバラノールAのようなCDK阻害剤の作用は、CCDC63の活性が細胞周期依存性のシグナル伝達経路を介して制御されている場合、間接的にCCDC63の阻害につながる可能性がある。MLN8237、ZM447439、BI 2536などの主要な有糸分裂キナーゼ阻害剤は、染色体の整列、紡錘体の組み立て、有糸分裂の終了などのプロセスを阻害することにより、CCDC63を阻害する可能性を示しており、これらはCCDC63の適切な機能に不可欠である可能性がある。
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