C9orf69の化学的活性化因子は、様々な細胞内シグナル伝達経路を開始し、様々なメカニズムでその活性化につながる。フォルスコリンは、細胞内のcAMPレベルを上昇させることにより、間接的にプロテインキナーゼA(PKA)を活性化する。活性化されたPKAは、C9orf69がPKAの基質である場合、C9orf69をリン酸化し、活性化につながる。イオノマイシンは細胞内カルシウム濃度を上昇させ、C9orf69と相互作用したり、C9orf69を調節したりするカルシウム依存性タンパク質を活性化する。同様に、フォルボール12-ミリスチン酸13-アセテート(PMA)はプロテインキナーゼC(PKC)を活性化し、C9orf69をリン酸化したり、その活性化をもたらすカスケードを開始することができるもう一つのキナーゼである。S-ニトロソ-N-アセチルペニシラミン(SNAP)は一酸化窒素を放出し、グアニル酸シクラーゼを刺激してcGMPレベルを上昇させ、C9orf69をリン酸化する可能性のあるプロテインキナーゼG(PKG)を活性化する。過酸化水素は様々なキナーゼの活性化につながるシグナル伝達分子として機能し、酸化ストレス経路を通じてC9orf69の活性に影響を与える可能性がある。
さらに、アニソマイシンはMAPK経路を誘発し、JNKやp38のようなストレス活性化プロテインキナーゼの活性化につながり、C9orf69をリン酸化し活性化する可能性がある。オカダ酸は、プロテインホスファターゼを阻害することにより、C9orf69をリン酸化された活性な状態に保つことができる。オワバインはNa+/K+-ATPaseポンプを阻害することにより、間接的に細胞内カルシウムレベルを上昇させ、C9orf69を活性化する可能性がある。タプシガルギンは、SERCAポンプを阻害することによってカルシウムのホメオスタシスを破壊し、細胞質カルシウムレベルの上昇を介してC9orf69を活性化する可能性がある。ブリオスタチン1はPKC活性を調節し、その結果C9orf69が活性化される可能性がある。cAMPアナログであるジブチリル-cAMPはPKAを直接活性化し、リン酸化を介してC9orf69を活性化する可能性がある。プロテインホスファターゼ1および2Aの強力な阻害剤であるカリンクリンAは、C9orf69の脱リン酸化を阻止することにより、C9orf69を活性化状態に維持することができる。これらの化学物質は、異なる経路とメカニズムを通して、全てC9orf69の活性化に寄与する可能性がある。
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