C2orf62タンパク質の化学的阻害剤は、様々な分子メカニズムを通じてその機能を阻害する。フロレチンはグルコーストランスポーターを阻害することでグルコース輸送を阻害し、C2orf62の活性に必要なエネルギー供給を制限する。ゲニステインはチロシンキナーゼを標的とする。チロシンキナーゼはタンパク質のリン酸化に重要な酵素であり、C2orf62を含むタンパク質の活性を変化させる化学的プロセスである。スタウロスポリンは、幅広いキナーゼ阻害能力で知られており、C2orf62の機能に不可欠である可能性のある複数のキナーゼ駆動経路を阻害することができる。LY294002とWortmanninはどちらもPI3K阻害剤である。PI3K活性を阻害することにより、C2orf62がその一部である可能性のある経路を含む、様々な細胞プロセスを制御するシグナル伝達経路に影響を与え、その活性を低下させる。
PD98059とU0126はMEKの阻害剤であり、MEKはMAPK/ERK経路の一部である。この経路は、C2orf62を含む細胞の成長と生存に関与するタンパク質の機能を制御する上で重要な役割を果たしている。SB203580とSP600125は、MAPKシグナル伝達経路の異なる構成要素、具体的にはそれぞれp38 MAPキナーゼとJNKを標的とする。これらの阻害は、C2orf62活性を制御する制御機構を破壊することができる。ラパマイシンは、細胞増殖と代謝の中心であるmTOR経路を阻害し、C2orf62機能の細胞環境に影響を与える。最後に、PP2とNSC23766は、細胞骨格ダイナミクスと様々な細胞機能に関連するシグナル伝達プロセスを阻害する。PP2はSrcファミリーキナーゼを阻害し、NSC23766はRac1を標的とするが、これらはいずれもC2orf62タンパク質の活性に影響を与えうる。
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