C17orf49_0610010K14Rik阻害剤は、多くのタンパク質が関与する広範な細胞プロセスを通して間接的にアプローチすることができる。タンパク質の機能や経路を調節する一般的な方法の一つは、シグナル伝達カスケードにおいて重要な役割を果たすキナーゼを標的とすることである。例えば、幅広いキナーゼ阻害剤であるスタウロスポリンは、複数の細胞経路に影響を与えることができ、一方、チロシンキナーゼ阻害剤であるゲニステインは、様々な細胞内シグナル伝達プロセスを変化させることができる。タンパク質合成と輸送の領域では、mTORを阻害するラパマイシンや、小胞体からのタンパク質輸送を阻害するブレフェルジンAのような化合物が使用できる。
エンドソームの酸性化と小胞輸送はクロロキンによって影響を受ける。細胞代謝の面では、2-デオキシグルコースが解糖の阻害剤として機能する。一方、タンパク質の制御におけるリン酸化の重要性は、ホスファターゼ阻害剤であるカリキュリンAによって強調される。極めて重要な細胞内シグナル伝達機構であるPI3K経路は、LY294002やWortmanninのような阻害剤を用いて標的とすることができる。
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