ASB-3阻害剤は、ユビキチン・プロテアソーム系と関連するタンパク質分解経路に影響を与えることによって作用する。なぜなら、ASB-3はE3ユビキチンリガーゼであり、その主な機能はタンパク質をプロテアソームによる分解のためにマークすることだからである。ボルテゾミブ、MG-132、エポキソマイシン、ラクタシスチンはすべてプロテアソーム阻害剤である。これらはプロテアソームを阻害し、ユビキチン化されたタンパク質の分解を妨げ、ASB-3が破壊のためにタンパク質をマークすることで維持しているバランスを崩す。その結果、ASB-3によってマークされたタンパク質が蓄積し、ASB-3の機能阻害につながる。
他の化合物もユビキチン・プロテアソームシステムを異なる方法で破壊する。例えばPYR-41は、ユビキチン活性化酵素E1を標的とすることでユビキチン化の開始を阻害し、ASB-3がタンパク質を分解するためのマークをつけるのを阻止する。MLN4924のような化合物は、ASB-3のようなE3ユビキチンリガーゼの重要な構成要素であるカリンの修飾に関与するNEDD8経路を標的とする。PR-619のような他の阻害剤は、ASB-3によってマークされたタンパク質の分解に不可欠な脱ユビキチン化過程を標的とする。エヤレスタチンIは小胞体関連分解経路を標的とし、これが阻害されると、ASB-3が関与するタンパク質合成と分解のバランスが崩れる。クロロキンとリューペプチンは、それぞれライソゾーム機能とプロテアーゼ活性を阻害し、どちらもASB-3によってマークされたタンパク質の分解に関与する。オーラノフィンは酸化ストレスを誘導し、ASB-3を含む多くのタンパク質の機能に直接影響を与える。
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