APOOL阻害剤には、APOOLを直接標的とするわけではないが、ミトコンドリアの動態や健康状態を変化させることでその機能に影響を与えることができる、さまざまな化合物が含まれる。これらのうち、Mdivi-1のように、ミトコンドリアの分裂と融合の動態に直接介入する阻害剤もある。CCCPやFCCPのように、酸化的リン酸化のカップリングを解除することによってミトコンドリアの健康を損なうものもある。
アンチマイシンA、ロテノン、アジドのような化合物は、電子輸送鎖に影響を与えることにより、間接的にAPOOLの機能にも影響を与える可能性がある。2-デオキシ-D-グルコースによる解糖の阻害は、ミトコンドリアが利用できる基質を減少させ、ミトコンドリアタンパク質のホメオスタシスを標的とするアクチノニンのような薬剤は、間接的にAPOOLに影響を与える可能性がある。細胞の健康、エネルギー産生、シグナル伝達におけるミトコンドリアの中心的役割を考えると、ミトコンドリアの動態に影響を及ぼす化合物は、APOOLを含む多くのタンパク質に広範な影響を及ぼす可能性がある。
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