プロテインホスファターゼ4調節サブユニット3C2(PP4R3C2)の化学的活性化剤は、様々な細胞内シグナル伝達経路を通して、その活性に影響を与えることができる。オカダ酸やカリクリンAは、どちらもある種のタンパク質ホスファターゼの強力な阻害剤であるが、基質の脱リン酸化を阻害することにより、間接的にPP4R3C2の活性を上昇させることができる。その結果、リン酸化されたタンパク質が蓄積すると、PP4R3C2の基質利用性が高まり、PP4R3C2が活性化される。同様に、フォルボール12-ミリスチン酸13-アセテート(PMA)は、プロテインキナーゼC(PKC)を活性化することにより、このタンパク質に作用し、様々な標的タンパク質をリン酸化する。PKCによって誘導されるリン酸化の変化は、PP4R3C2またはその関連タンパク質を直接修飾することによってPP4R3C2に影響を与え、そのホスファターゼ活性の活性化につながる。
一方、フォルスコリン、8-ブロモ-cAMP、およびジブチリル-cAMPは、細胞内のサイクリックAMP(cAMP)レベルを上昇させることによって機能し、その結果、プロテインキナーゼA(PKA)が活性化される。活性化されたPKAは、PP4R3C2を含むタンパク質複合体の構成要素をリン酸化し、その結果、PP4R3C2を活性化することができる。さらに、イオノマイシンやタプシガルギンは細胞内カルシウムレベルを上昇させ、カルシニューリンのようなリン酸化酵素を活性化させる。このようなカルシウム依存性の経路は、複合的なリン酸化・脱リン酸化カスケードを通して、間接的にPP4R3C2の活性に影響を与える可能性がある。ノノ酸スペルミンは一酸化窒素(NO)を放出し、可溶性グアニリルシクラーゼを活性化し、サイクリックGMP(cGMP)レベルを上昇させ、プロテインキナーゼG(PKG)の活性化を通じてPP4R3C2の活性に影響を与える可能性がある。さらに、過酸化水素は酸化剤として働き、ホスファターゼの酸化還元状態を変化させ、PP4R3C2を活性化する構造変化を引き起こす可能性がある。最後に、硫酸亜鉛は直接結合することで酵素活性を調節し、オルソバナジン酸ナトリウムはチロシンホスファターゼを阻害することで細胞内のリン酸化ダイナミクスを変化させ、PP4R3C2の活性プロファイルに影響を与える。
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