POTEG阻害剤は、アンキリングドメインが関与するシグナル伝達経路やタンパク質相互作用に影響を与えることによって、POTEGの機能を間接的に調節する様々な化学薬剤を包含する。これらの阻害剤は通常、調節されるとPOTEGの活性に影響を与えうる他のタンパク質や経路を標的とする。例えば、シクロスポリンAやFK506のようなイムノフィリンリガンドは、T細胞活性化に重要な役割を果たすリン酸化酵素であるカルシニューリンを阻害することによって、細胞内シグナル伝達を変化させる。このような阻害は、アンキリングドメインタンパク質が作用する細胞内状況を変える可能性がある。W-7塩酸塩のようなカルモジュリン拮抗薬は、普遍的な細胞内メッセンジャーシステムであるカルシウムシグナル伝達を破壊し、おそらく間接的にアンキリングドメイン含有タンパク質の機能に影響を与えるであろう。
PD98059、LY294002、U0126、SB203580、SP600125、D4476のようなキナーゼ阻害剤は、POTEGに関連すると思われるものを含む多くのシグナル伝達経路に不可欠な様々なキナーゼを標的とする。これらのキナーゼの活性を変えることにより、阻害剤は間接的にPOTEGが関与する生物学的過程に影響を与えることができる。細胞増殖と代謝の中心的調節因子であるmTOR経路を標的とするラパマイシンの作用は、タンパク質合成機構に影響を与え、それによってPOTEGと相互作用するタンパク質に影響を与える可能性がある。Y-27632のようなROCK阻害剤は、細胞骨格のダイナミクスを調節し、アンキリン・ドメインを含むタンパク質を含む細胞内のタンパク質の空間構成に影響を与える可能性がある。最後に、抗寄生虫剤であるイベルメクチンは、イオンチャネルを調節することによって、細胞のイオン環境を変化させ、POTEGのようなアンキリングドメインを持つタンパク質の機能に間接的に影響を与える可能性がある。
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