Not CRISPR data: the image illustrates antibody quality for visualizing CRISPR experiment results.
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XTP3TPA CRISPR/Cas9 KO Plasmid (h): sc-407430
- Zielspezies: human
- 20 µg transfektionsfertige, aufgereinigte Plasmid DNA; geeignet für 20 Transfektionen
- XTP3TPA Das CRISPR/Cas9-Knockout (KO)-Plasmid (h) ist ein Pool von Plasmiden, von denen jedes für die Cas9-Nuklease und eine zielspezifische 20-nt-Guide-RNA (gRNA) kodiert, die für maximale Knockout-Effizienz unter Verwendung von Sequenzen aus der GeCKO v2-Bibliothek entwickelt wurde
- gRNA-Sequenzen lenken Cas9 so, dass es ortsspezifische Doppelstrangbrüche (DSBs) im XTP3TPA-Genomlokus induziert, was zu einem Gen-Knockout durch nicht-homologe Endverknüpfung (NHEJ) führt
- Die Puromycin-Resistenz- und RFP-Gene werden von LoxP-Stellen flankiert, was die Entfernung der Selektionsmarker mittels Cre-Rekombinase (Cre-Vektor: sc-418923) nach der Etablierung stabiler Knockout-Zelllinien ermöglicht
- Nach der Transfektion kann die Effizienz des Gen-Knockouts per Western Blot oder histologisch mit folgendem Antikörper überprüft werden: XTP3TPA: sc-398501
Bestellinformation
| Produkt | Katalog # | EINHEIT | Preis | ANZAHL | Favoriten | |
XTP3TPA CRISPR/Cas9 KO Plasmid (h) | sc-407430 | 20 µg | $397.00 |
Übersicht
DCTPP1 kodiert XTP3TPA, eine zytosolische dCTP-Pyrophosphatase, die nicht-kanonische Desoxynukleosid-Triphosphate hydrolysiert und so dazu beiträgt, ausgeglichene dNTP-Pools sowie die Qualitätskontrolle von Nukleotiden aufrechtzuerhalten. Indem XTP3TPA die Einlagerung abweichender Nukleotide in die DNA begrenzt, unterstützt es Genomstabilität, Replikationstreue und die koordinierte Steuerung von DNA-Reparatur sowie Reaktionen auf Replikationsstress. Veränderte Nukleotidmetabolik und ein Ungleichgewicht der dNTP-Pools sind häufige Merkmale proliferativer Zustände und der Tumorbiologie, wodurch DCTPP1 einen geeigneten Ansatzpunkt bietet, um Zusammenhänge zwischen Nukleotid-Sanitisierung, oxidativen Schäden und Mutagenese zu untersuchen. Die funktionelle Untersuchung von DCTPP1 kann Mechanismen aufklären, die metabolische Umprogrammierung mit DNA-Schadenssignalen und Zellzykluskontrolle in humanen Zellen verbinden.
Das XTP3TPA CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (h) ist ein Pool von Plasmiden, die für die gezielte Disruption des DCTPP1-Gens in human-Zelllinien entwickelt wurden. Jedes Plasmid koexprimiert eine einzigartige Single-Guide-RNA (sgRNA), die auf eine bestimmte Stelle innerhalb des DCTPP1-Gens abzielt, zusammen mit der Streptococcus pyogenes Cas9-Nuklease. Die Plasmide kodieren zudem für GFP, was die fluoreszente Identifizierung und Anreicherung erfolgreich transfizierter Zellen mittels Fluoreszenzmikroskopie oder Durchflusszytometrie ermöglicht.
Das Multi-Guide-Design erhöht die Wahrscheinlichkeit, dass Insertionen oder Deletionen (Indels) entstehen, die den offenen Leserahmen von DCTPP1 nach der Cas9-vermittelten Bildung von Doppelstrangbrüchen unterbrechen. Durch das CRISPR/Cas9-System verursachte DNA-Brüche werden über endogene NHEJ-Wege (Non-Homologous End Joining) repariert, was häufig zu Frameshift-Mutationen führt, die die XTP3TPA-Proteinexpression aufheben.
Dieses CRISPR-Knockout-System ermöglicht die effiziente Erzeugung von DCTPP1-defizienten Zellmodellen zur Untersuchung der XTP3TPA-Signalübertragung, für funktionelle Genomstudien, in der Krebsbiologieforschung sowie zur Bewertung therapeutischer Reaktionen in menschlichen Zelllinien.
Hauptmerkmale
- sgRNAs, die auf DCTPP1-Exone abzielen, die für die XTP3TPA-Funktion entscheidend sind
Ko-Expression von SpCas9 und sgRNA aus einem einzigen Plasmid zur vereinfachten Verabreichung
GFP-Reporter zur Identifizierung transfizierter Zellen
Pool von Plasmiden, die auf mehrere DCTPP1-Genomstellen abzielen, um die Knockout-Effizienz zu verbessern
Kompatibel mit der Verabreichung durch Transfektion
Designvarianten
CRISPRs +/- HDRs
- gRNAs, die vom XTP3TPA CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (h) und vom XTP3TPA CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (h2) kodiert werden, zielen auf unterschiedliche Stellen innerhalb des DCTPP1-Lokus ab. Es kann ein oder beide Targeting-Designs verfügbar sein. Siehe „Verwandte Produkte“ für Verfügbarkeit.
HDR-Donorkonstrukte, kodiert durch das XTP3TPA HDR-Plasmid (h) und XTP3TPA HDR-Plasmid (h2) kodiert, enthalten eine Puromycin-Resistenzkassette und einen RFP-Reporter, flankiert von DCTPP1-Homologiearmen, um die homologe Reparatur an definierten DCTPP1-Zielstellen entsprechend den CRISPR/Cas9-KO-Designs zu unterstützen. Die Verfügbarkeit von HDR-Donoren kann variieren. Siehe „Verwandte Produkte“ für Verfügbarkeit.
Nur für Forschungszwecke. Nicht für diagnostische oder therapeutische Zwecke bestimmt.