UBXD7 CRISPR/Cas9 KO Plasmid (m): sc-432436

Übersicht

Ubxn7 kodiert UBXD7, einen Adapter mit UBX-Domäne, der die ubiquitinabhängige Verarbeitung von Substraten an die p97/VCP-ATPase-Maschinerie koppelt. UBXD7 trägt zur Proteostase bei, indem es die Erkennung von Ubiquitinketten reguliert und die Verarbeitung ubiquitylierter Proteine in Signalwegen wie dem ER-assoziierten Abbau (ERAD) sowie der Qualitätskontrolle steckengebliebener oder beschädigter Proteinkomplexe erleichtert. Über diese Funktionen beeinflusst UBXD7 zelluläre Stressantworten, Proteinumsatz und Signaloutputs, die mit der Dynamik des Ubiquitin-Proteasom-Systems verknüpft sind. Eine Fehlregulation p97/VCP-zentrierter Proteostase-Netzwerke ist breit relevant für Neurodegeneration und krebsassoziierte Vulnerabilitäten, wodurch Ubxn7 einen nützlichen Knotenpunkt für mechanistische Studien in Mausmodellen darstellt.

Das UBXD7 CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (m) ist ein Pool von Plasmiden, die für die gezielte Disruption des Ubxn7-Gens in mouse-Zelllinien entwickelt wurden. Jedes Plasmid koexprimiert eine einzigartige Single-Guide-RNA (sgRNA), die auf eine bestimmte Stelle innerhalb des Ubxn7-Gens abzielt, zusammen mit der Streptococcus pyogenes Cas9-Nuklease. Die Plasmide kodieren zudem für GFP, was die fluoreszente Identifizierung und Anreicherung erfolgreich transfizierter Zellen mittels Fluoreszenzmikroskopie oder Durchflusszytometrie ermöglicht.

Das Multi-Guide-Design erhöht die Wahrscheinlichkeit, dass Insertionen oder Deletionen (Indels) entstehen, die den offenen Leserahmen von Ubxn7 nach der Cas9-vermittelten Bildung von Doppelstrangbrüchen unterbrechen. Durch das CRISPR/Cas9-System verursachte DNA-Brüche werden über endogene NHEJ-Wege (Non-Homologous End Joining) repariert, was häufig zu Frameshift-Mutationen führt, die die UBXD7-Proteinexpression aufheben.

Dieses CRISPR-Knockout-System ermöglicht die effiziente Erzeugung von Ubxn7-defizienten Zellmodellen zur Untersuchung der UBXD7-Signalübertragung, für funktionelle Genomstudien, in der Krebsbiologieforschung sowie zur Bewertung therapeutischer Reaktionen in menschlichen Zelllinien.

Hauptmerkmale

• sgRNAs, die auf Ubxn7-Exone abzielen, die für die UBXD7-Funktion entscheidend sind
  Ko-Expression von SpCas9 und sgRNA aus einem einzigen Plasmid zur vereinfachten Verabreichung
  GFP-Reporter zur Identifizierung transfizierter Zellen
  Pool von Plasmiden, die auf mehrere Ubxn7-Genomstellen abzielen, um die Knockout-Effizienz zu verbessern
  Kompatibel mit der Verabreichung durch Transfektion

Designvarianten

CRISPRs +/- HDRs

• gRNAs, die vom UBXD7 CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (m) und vom UBXD7 CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (m2) kodiert werden, zielen auf unterschiedliche Stellen innerhalb des Ubxn7-Lokus ab. Es kann ein oder beide Targeting-Designs verfügbar sein. Siehe „Verwandte Produkte“ für Verfügbarkeit.
  HDR-Donorkonstrukte, kodiert durch das UBXD7 HDR-Plasmid (m) und UBXD7 HDR-Plasmid (m2) kodiert, enthalten eine Puromycin-Resistenzkassette und einen RFP-Reporter, flankiert von Ubxn7-Homologiearmen, um die homologe Reparatur an definierten Ubxn7-Zielstellen entsprechend den CRISPR/Cas9-KO-Designs zu unterstützen. Die Verfügbarkeit von HDR-Donoren kann variieren. Siehe „Verwandte Produkte“ für Verfügbarkeit.

Nur für Forschungszwecke. Nicht für diagnostische oder therapeutische Zwecke bestimmt.