TRIM41 Plasmide KO CRISPR/Cas9 (h): sc-413871

Panoramica

TRIM41 codifica una proteina contenente un motivo tripartito (TRIM) con attività di E3 ubiquitina ligasi di tipo RING finger, che contribuisce alla proteostasi dipendente dall’ubiquitina e alla regolazione dei complessi di segnalazione. Nell’ambito delle reti della famiglia TRIM, TRIM41 è implicata nel controllo della stabilità e del turnover proteico, influenzando vie legate alla regolazione dell’immunità innata, alle risposte allo stress e al mantenimento dell’omeostasi cellulare. Alterazioni della dinamica di ubiquitinazione che coinvolgono le proteine TRIM sono state associate a una segnalazione infiammatoria disregolata e a fenotipi oncogenici, rendendo TRIM41 un bersaglio utile per analizzare il contributo delle vie dell’ubiquitina a stati cellulari rilevanti per la malattia. L’analisi funzionale di TRIM41 supporta studi sul riconoscimento dei substrati, sul crosstalk tra modificazioni post-traduzionali e sugli effetti a livello di via sui profili trascrizionali e proteomici.

Il plasmide CRISPR/Cas9 KO TRIM41 (h) è un pool di plasmidi progettato per la distruzione mirata del gene TRIM41 in linee cellulari human. Ciascun plasmide co-esprime un singolo RNA guida (sgRNA) unico che prende di mira un sito distinto all'interno del TRIM41 insieme alla nucleasi Cas9 di Streptococcus pyogenes. I plasmidi codificano anche per la GFP, consentendo l'identificazione fluorescente e l'arricchimento delle cellule trasfettate con successo tramite microscopia a fluorescenza o citometria a flusso.

Il design multi-guida aumenta la probabilità di generare inserzioni o delezioni (indels) che interrompono il frame di lettura aperto TRIM41 a seguito della formazione di rotture a doppio filamento mediate da Cas9. Le rotture del DNA introdotte dal sistema CRISPR/Cas9 vengono riparate attraverso vie endogene di giunzione non omologa (NHEJ), che spesso provocano mutazioni con spostamento del frame che annullano l'espressione della proteina TRIM41.

Questo sistema di knockout CRISPR consente la generazione efficiente di modelli cellulari carenti di TRIM41 per lo studio della segnalazione di TRIM41, studi di genomica funzionale, ricerca sulla biologia del cancro e valutazione delle risposte terapeutiche in linee cellulari umane.

Caratteristiche principali

• sgRNA mirati agli esoni TRIM41 critici per la funzione di TRIM41
  Co-espressione di SpCas9 e sgRNA da un singolo plasmide per una somministrazione semplificata
  Reporter GFP per l'identificazione delle cellule trasfettate
  Pool di plasmidi mirati a più siti genomici di TRIM41 per migliorare l'efficienza del knockout
  Compatibile con la somministrazione tramite trasfezione

Varianti di progettazione

CRISPR +/- HDR

• Gli gRNA codificati dal TRIM41 CRISPR/Cas9 KO Plasmid (h) e dal TRIM41 CRISPR/Cas9 KO Plasmid (h2) prendono di mira siti distinti all'interno del locus TRIM41. Potrebbe essere disponibile uno o entrambi i design di targeting. Vedere Prodotti correlati per la disponibilità.
  I costrutti donatori HDR codificati dal TRIM41 Plasmide HDR (h) e il plasmide HDR TRIM41 (h2) contengono una cassetta di resistenza alla puromicina e un reporter RFP affiancato da bracci di omologia TRIM41 per supportare la riparazione diretta dall'omologia in siti bersaglio TRIM41 definiti corrispondenti ai disegni CRISPR/Cas9 KO. La disponibilità dei donatori HDR può variare. Vedere Prodotti correlati per la disponibilità.

Solo per uso di ricerca. Non destinato a uso diagnostico o terapeutico.