SURF-2 CRISPR/Cas9 KO Plasmid (m): sc-423220

Übersicht

Surf2 kodiert SURF-2, ein konserviertes nukleäres Protein aus dem Surfeit-Gencluster, das mit grundlegenden Mechanismen der Genexpressionskontrolle in Verbindung gebracht wurde. SURF-2 ist an der RNA-Polymerase-II-abhängigen Transkriptionsregulation sowie an chromatinassoziierten Prozessen beteiligt, die die zelluläre Homöostase beeinflussen. Störungen von SURF-2-assoziierten regulatorischen Netzwerken können Proliferation, Stressantworten und Differenzierungsprogramme beeinträchtigen, wodurch Surf2 einen nützlichen Knotenpunkt für die Untersuchung von Genomstabilität und transkriptioneller Pufferung darstellt. Eine veränderte Expression von Genen des Surfeit-Clusters wurde in mehreren krankheitsrelevanten Kontexten beobachtet, was mechanistische Untersuchungen von Surf2 in Zuständen dysregulierter Genexpression unterstützt.

Das SURF-2 CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (m) ist ein Pool von Plasmiden, die für die gezielte Disruption des Surf2-Gens in mouse-Zelllinien entwickelt wurden. Jedes Plasmid koexprimiert eine einzigartige Single-Guide-RNA (sgRNA), die auf eine bestimmte Stelle innerhalb des Surf2-Gens abzielt, zusammen mit der Streptococcus pyogenes Cas9-Nuklease. Die Plasmide kodieren zudem für GFP, was die fluoreszente Identifizierung und Anreicherung erfolgreich transfizierter Zellen mittels Fluoreszenzmikroskopie oder Durchflusszytometrie ermöglicht.

Das Multi-Guide-Design erhöht die Wahrscheinlichkeit, dass Insertionen oder Deletionen (Indels) entstehen, die den offenen Leserahmen von Surf2 nach der Cas9-vermittelten Bildung von Doppelstrangbrüchen unterbrechen. Durch das CRISPR/Cas9-System verursachte DNA-Brüche werden über endogene NHEJ-Wege (Non-Homologous End Joining) repariert, was häufig zu Frameshift-Mutationen führt, die die SURF-2-Proteinexpression aufheben.

Dieses CRISPR-Knockout-System ermöglicht die effiziente Erzeugung von Surf2-defizienten Zellmodellen zur Untersuchung der SURF-2-Signalübertragung, für funktionelle Genomstudien, in der Krebsbiologieforschung sowie zur Bewertung therapeutischer Reaktionen in menschlichen Zelllinien.

Hauptmerkmale

• sgRNAs, die auf Surf2-Exone abzielen, die für die SURF-2-Funktion entscheidend sind
  Ko-Expression von SpCas9 und sgRNA aus einem einzigen Plasmid zur vereinfachten Verabreichung
  GFP-Reporter zur Identifizierung transfizierter Zellen
  Pool von Plasmiden, die auf mehrere Surf2-Genomstellen abzielen, um die Knockout-Effizienz zu verbessern
  Kompatibel mit der Verabreichung durch Transfektion

Designvarianten

CRISPRs +/- HDRs

• gRNAs, die vom SURF-2 CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (m) und vom SURF-2 CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (m2) kodiert werden, zielen auf unterschiedliche Stellen innerhalb des Surf2-Lokus ab. Es kann ein oder beide Targeting-Designs verfügbar sein. Siehe „Verwandte Produkte“ für Verfügbarkeit.
  HDR-Donorkonstrukte, kodiert durch das SURF-2 HDR-Plasmid (m) und SURF-2 HDR-Plasmid (m2) kodiert, enthalten eine Puromycin-Resistenzkassette und einen RFP-Reporter, flankiert von Surf2-Homologiearmen, um die homologe Reparatur an definierten Surf2-Zielstellen entsprechend den CRISPR/Cas9-KO-Designs zu unterstützen. Die Verfügbarkeit von HDR-Donoren kann variieren. Siehe „Verwandte Produkte“ für Verfügbarkeit.

Nur für Forschungszwecke. Nicht für diagnostische oder therapeutische Zwecke bestimmt.