SSRP1 CRISPR/Cas9 KO Plasmid (h): sc-401780

Übersicht

SSRP1 (structure specific recognition protein 1) ist eine essenzielle Untereinheit des FACT‑Chromatin‑Remodeling‑Komplexes, der während Transkription, DNA‑Replikation und DNA‑Reparatur die Demontage und erneute Assemblierung von Nukleosomen erleichtert. Indem SSRP1 die Histon‑Chaperon‑Aktivität mit dem Fortschreiten der RNA‑Polymerase II und der Dynamik der Replikationsgabel koordiniert, trägt es zur Aufrechterhaltung der Genomstabilität bei und reguliert die Zugänglichkeit des Chromatins. SSRP1‑abhängige Prozesse überschneiden sich mit der Zellzykluskontrolle, DNA‑Schadensantworten und epigenetischer Regulation und sind damit relevant für Studien zu Replikationsstress und aberranten Transkriptionsprogrammen. Eine Fehlregulation der FACT/SSRP1‑Aktivität wurde mit onkogenen Chromatinzuständen und veränderter Proliferationsfähigkeit in Verbindung gebracht, was SSRP1 als mechanistischen Knotenpunkt in der Krebsbiologie sowie der Genom‑ und Genomstabilitätsforschung stützt.

Das SSRP1 CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (h) ist ein Pool von Plasmiden, die für die gezielte Disruption des SSRP1-Gens in human-Zelllinien entwickelt wurden. Jedes Plasmid koexprimiert eine einzigartige Single-Guide-RNA (sgRNA), die auf eine bestimmte Stelle innerhalb des SSRP1-Gens abzielt, zusammen mit der Streptococcus pyogenes Cas9-Nuklease. Die Plasmide kodieren zudem für GFP, was die fluoreszente Identifizierung und Anreicherung erfolgreich transfizierter Zellen mittels Fluoreszenzmikroskopie oder Durchflusszytometrie ermöglicht.

Das Multi-Guide-Design erhöht die Wahrscheinlichkeit, dass Insertionen oder Deletionen (Indels) entstehen, die den offenen Leserahmen von SSRP1 nach der Cas9-vermittelten Bildung von Doppelstrangbrüchen unterbrechen. Durch das CRISPR/Cas9-System verursachte DNA-Brüche werden über endogene NHEJ-Wege (Non-Homologous End Joining) repariert, was häufig zu Frameshift-Mutationen führt, die die SSRP1-Proteinexpression aufheben.

Dieses CRISPR-Knockout-System ermöglicht die effiziente Erzeugung von SSRP1-defizienten Zellmodellen zur Untersuchung der SSRP1-Signalübertragung, für funktionelle Genomstudien, in der Krebsbiologieforschung sowie zur Bewertung therapeutischer Reaktionen in menschlichen Zelllinien.

Hauptmerkmale

• sgRNAs, die auf SSRP1-Exone abzielen, die für die SSRP1-Funktion entscheidend sind
  Ko-Expression von SpCas9 und sgRNA aus einem einzigen Plasmid zur vereinfachten Verabreichung
  GFP-Reporter zur Identifizierung transfizierter Zellen
  Pool von Plasmiden, die auf mehrere SSRP1-Genomstellen abzielen, um die Knockout-Effizienz zu verbessern
  Kompatibel mit der Verabreichung durch Transfektion

Designvarianten

CRISPRs +/- HDRs

• gRNAs, die vom SSRP1 CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (h) und vom SSRP1 CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (h2) kodiert werden, zielen auf unterschiedliche Stellen innerhalb des SSRP1-Lokus ab. Es kann ein oder beide Targeting-Designs verfügbar sein. Siehe „Verwandte Produkte“ für Verfügbarkeit.
  HDR-Donorkonstrukte, kodiert durch das SSRP1 HDR-Plasmid (h) und SSRP1 HDR-Plasmid (h2) kodiert, enthalten eine Puromycin-Resistenzkassette und einen RFP-Reporter, flankiert von SSRP1-Homologiearmen, um die homologe Reparatur an definierten SSRP1-Zielstellen entsprechend den CRISPR/Cas9-KO-Designs zu unterstützen. Die Verfügbarkeit von HDR-Donoren kann variieren. Siehe „Verwandte Produkte“ für Verfügbarkeit.

Nur für Forschungszwecke. Nicht für diagnostische oder therapeutische Zwecke bestimmt.