SDS3 Plásmido CRISPR/Cas9 KO (h): sc-413010

Descripción general

SUDS3 codifica SDS3, un componente central del complejo correpresor transcripcional Sin3A/HDAC, que acopla la remodelación de la cromatina a la desacetilación de histonas. Mediante el reclutamiento de HDAC1/2 y de factores asociados, SDS3 contribuye a programas de represión transcripcional que modulan la progresión del ciclo celular, la especificación de linajes y las respuestas a señales del desarrollo y del estrés. La regulación de la cromatina dependiente de SDS3 influye en la estabilidad del genoma y la homeostasis epigenética, vinculando cambios en la composición o la actividad del complejo con estados de expresión génica aberrantes. La desregulación de la represión mediada por Sin3/HDAC y de vías epigenéticas relacionadas se asocia con frecuencia a la biología del cáncer y, en un sentido más amplio, a fenotipos del neurodesarrollo y de la diferenciación.

El plásmido CRISPR/Cas9 KO SDS3 (h) es un conjunto de plásmidos diseñado para la interrupción dirigida del gen SUDS3 en líneas celulares human. Cada plásmido coexpresa un ARN guía único (sgRNA) dirigido a un sitio distinto dentro del SUDS3 junto con la nucleasa Cas9 de Streptococcus pyogenes. Los plásmidos también codifican GFP, lo que permite la identificación fluorescente y el enriquecimiento de las células transfectadas con éxito mediante microscopía de fluorescencia o citometría de flujo.

El diseño multiguía aumenta la probabilidad de generar inserciones o deleciones (indeles) que interrumpan el marco de lectura abierto de SUDS3 tras la formación de roturas de doble cadena mediadas por Cas9. Las roturas de ADN introducidas por el sistema CRISPR/Cas9 se reparan a través de vías endógenas de unión de extremos no homólogos (NHEJ), lo que con frecuencia da lugar a mutaciones de desplazamiento del marco de lectura que anulan la expresión de la proteína SDS3.

Este sistema de knockout CRISPR permite la generación eficiente de modelos celulares deficientes en SUDS3 para la investigación de la señalización de SDS3, estudios de genómica funcional, investigación en biología del cáncer y evaluación de respuestas terapéuticas en líneas celulares humanas.

Características principales

• sgRNA dirigidos a los exones de SUDS3 críticos para la función de SDS3
  Coexpresión de SpCas9 y sgRNA a partir de un único plásmido para simplificar la administración
  Reportero GFP para la identificación de células transfectadas
  Conjunto de plásmidos dirigidos a múltiples sitios genómicos de SUDS3 para mejorar la eficiencia del knockout
  Compatible con la administración mediante transfección

Variantes de diseño

CRISPRs +/- HDRs

• Los gRNA codificados por el plásmido SDS3 CRISPR/Cas9 KO (h) y el plásmido SDS3 CRISPR/Cas9 KO (h2) se dirigen a sitios distintos dentro del locus SUDS3. Puede estar disponible uno o ambos diseños de orientación. Consulte «Productos relacionados» para conocer la disponibilidad.
  Las construcciones donantes HDR codificadas por el plásmido HDR SDS3 (h) y el plásmido HDR SDS3 (h2) contienen un casete de resistencia a la puromicina y un reportero RFP flanqueado por brazos de homología SUDS3 para facilitar la reparación dirigida por homología en sitios diana SUDS3 definidos que se corresponden con los diseños de KO de CRISPR/Cas9. La disponibilidad de los donantes HDR puede variar. Consulte «Productos relacionados» para conocer la disponibilidad.

Sólo para uso en investigación. No destinado a uso diagnóstico o terapéutico.