NYNRIN CRISPR/Cas9 KO Plasmid (h): sc-410066

Übersicht

NYNRIN kodiert ein großes Multidomänenprotein, das Berichten zufolge NYN- sowie retroviraler-Integrase-ähnliche Regionen enthält. Dies deutet auf eine mögliche Beteiligung an Interaktionen mit Nukleinsäuren oder Proteinkomplexen hin, auch wenn seine genaue molekulare Funktion in menschlichen Zellen bislang nicht vollständig charakterisiert ist. Transkriptomische Studien haben die NYNRIN-Expression mit Entwicklungs- und Differenzierungsprogrammen sowie mit der Regulation der zellulären Homöostase in bestimmten Geweben in Verbindung gebracht. Veränderte NYNRIN-Expression wurde in verschiedenen Krankheitskontexten beobachtet, was seine Eignung als Kandidatenfaktor für die Untersuchung fehlregulierter Genexpressionsnetzwerke unterstützt. Als vergleichsweise wenig untersuchtes Gen wird NYNRIN häufig herangezogen, um die Vernetzung von Signalwegen, Zellzustandsübergänge und Phänotypen zu definieren, die aus der Perturbation schlecht annotierter Regulatoren entstehen.

Das NYNRIN CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (h) ist ein Pool von Plasmiden, die für die gezielte Disruption des NYNRIN-Gens in human-Zelllinien entwickelt wurden. Jedes Plasmid koexprimiert eine einzigartige Single-Guide-RNA (sgRNA), die auf eine bestimmte Stelle innerhalb des NYNRIN-Gens abzielt, zusammen mit der Streptococcus pyogenes Cas9-Nuklease. Die Plasmide kodieren zudem für GFP, was die fluoreszente Identifizierung und Anreicherung erfolgreich transfizierter Zellen mittels Fluoreszenzmikroskopie oder Durchflusszytometrie ermöglicht.

Das Multi-Guide-Design erhöht die Wahrscheinlichkeit, dass Insertionen oder Deletionen (Indels) entstehen, die den offenen Leserahmen von NYNRIN nach der Cas9-vermittelten Bildung von Doppelstrangbrüchen unterbrechen. Durch das CRISPR/Cas9-System verursachte DNA-Brüche werden über endogene NHEJ-Wege (Non-Homologous End Joining) repariert, was häufig zu Frameshift-Mutationen führt, die die NYNRIN-Proteinexpression aufheben.

Dieses CRISPR-Knockout-System ermöglicht die effiziente Erzeugung von NYNRIN-defizienten Zellmodellen zur Untersuchung der NYNRIN-Signalübertragung, für funktionelle Genomstudien, in der Krebsbiologieforschung sowie zur Bewertung therapeutischer Reaktionen in menschlichen Zelllinien.

Hauptmerkmale

• sgRNAs, die auf NYNRIN-Exone abzielen, die für die NYNRIN-Funktion entscheidend sind
  Ko-Expression von SpCas9 und sgRNA aus einem einzigen Plasmid zur vereinfachten Verabreichung
  GFP-Reporter zur Identifizierung transfizierter Zellen
  Pool von Plasmiden, die auf mehrere NYNRIN-Genomstellen abzielen, um die Knockout-Effizienz zu verbessern
  Kompatibel mit der Verabreichung durch Transfektion

Designvarianten

CRISPRs +/- HDRs

• gRNAs, die vom NYNRIN CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (h) und vom NYNRIN CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (h2) kodiert werden, zielen auf unterschiedliche Stellen innerhalb des NYNRIN-Lokus ab. Es kann ein oder beide Targeting-Designs verfügbar sein. Siehe „Verwandte Produkte“ für Verfügbarkeit.
  HDR-Donorkonstrukte, kodiert durch das NYNRIN HDR-Plasmid (h) und NYNRIN HDR-Plasmid (h2) kodiert, enthalten eine Puromycin-Resistenzkassette und einen RFP-Reporter, flankiert von NYNRIN-Homologiearmen, um die homologe Reparatur an definierten NYNRIN-Zielstellen entsprechend den CRISPR/Cas9-KO-Designs zu unterstützen. Die Verfügbarkeit von HDR-Donoren kann variieren. Siehe „Verwandte Produkte“ für Verfügbarkeit.

Nur für Forschungszwecke. Nicht für diagnostische oder therapeutische Zwecke bestimmt.