IFRD2 CRISPR/Cas9 KO Plasmid (m): sc-421054

Übersicht

Der Interferon-related developmental regulator 2 (IFRD2) ist ein transkriptioneller Koregulator, der an der Steuerung von Genexpressionsprogrammen beteiligt ist, welche die zelluläre Differenzierung und stressadaptive Antworten prägen. In Mausmodellen wird IFRD2 hinsichtlich seiner potenziellen Rollen bei der Modulation chromatinassoziierter transkriptioneller Komplexe und der Koordination kontextabhängiger Signalausgaben untersucht, die Proliferation und Linienfestlegung beeinflussen. Eine veränderte Regulation von Proteinen der IFRD-Familie wurde mit gestörten Entwicklungsprozessen sowie aberranter inflammatorischer oder Stressantwort-Signalgebung in Verbindung gebracht, was Ifrd2 zu einem nützlichen Lokus für mechanistische Studien zur Gewebehomöostase macht. Das Targeting von Ifrd2 kann helfen zu klären, wie Dynamiken der transkriptionellen Repression/Aktivierung mit nachgeschalteten Signalwegen zusammenwirken, die Zellschicksal und Remodeling steuern.

Das IFRD2 CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (m) ist ein Pool von Plasmiden, die für die gezielte Disruption des Ifrd2-Gens in mouse-Zelllinien entwickelt wurden. Jedes Plasmid koexprimiert eine einzigartige Single-Guide-RNA (sgRNA), die auf eine bestimmte Stelle innerhalb des Ifrd2-Gens abzielt, zusammen mit der Streptococcus pyogenes Cas9-Nuklease. Die Plasmide kodieren zudem für GFP, was die fluoreszente Identifizierung und Anreicherung erfolgreich transfizierter Zellen mittels Fluoreszenzmikroskopie oder Durchflusszytometrie ermöglicht.

Das Multi-Guide-Design erhöht die Wahrscheinlichkeit, dass Insertionen oder Deletionen (Indels) entstehen, die den offenen Leserahmen von Ifrd2 nach der Cas9-vermittelten Bildung von Doppelstrangbrüchen unterbrechen. Durch das CRISPR/Cas9-System verursachte DNA-Brüche werden über endogene NHEJ-Wege (Non-Homologous End Joining) repariert, was häufig zu Frameshift-Mutationen führt, die die IFRD2-Proteinexpression aufheben.

Dieses CRISPR-Knockout-System ermöglicht die effiziente Erzeugung von Ifrd2-defizienten Zellmodellen zur Untersuchung der IFRD2-Signalübertragung, für funktionelle Genomstudien, in der Krebsbiologieforschung sowie zur Bewertung therapeutischer Reaktionen in menschlichen Zelllinien.

Hauptmerkmale

• sgRNAs, die auf Ifrd2-Exone abzielen, die für die IFRD2-Funktion entscheidend sind
  Ko-Expression von SpCas9 und sgRNA aus einem einzigen Plasmid zur vereinfachten Verabreichung
  GFP-Reporter zur Identifizierung transfizierter Zellen
  Pool von Plasmiden, die auf mehrere Ifrd2-Genomstellen abzielen, um die Knockout-Effizienz zu verbessern
  Kompatibel mit der Verabreichung durch Transfektion

Designvarianten

CRISPRs +/- HDRs

• gRNAs, die vom IFRD2 CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (m) und vom IFRD2 CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (m2) kodiert werden, zielen auf unterschiedliche Stellen innerhalb des Ifrd2-Lokus ab. Es kann ein oder beide Targeting-Designs verfügbar sein. Siehe „Verwandte Produkte“ für Verfügbarkeit.
  HDR-Donorkonstrukte, kodiert durch das IFRD2 HDR-Plasmid (m) und IFRD2 HDR-Plasmid (m2) kodiert, enthalten eine Puromycin-Resistenzkassette und einen RFP-Reporter, flankiert von Ifrd2-Homologiearmen, um die homologe Reparatur an definierten Ifrd2-Zielstellen entsprechend den CRISPR/Cas9-KO-Designs zu unterstützen. Die Verfügbarkeit von HDR-Donoren kann variieren. Siehe „Verwandte Produkte“ für Verfügbarkeit.

Nur für Forschungszwecke. Nicht für diagnostische oder therapeutische Zwecke bestimmt.