HS3ST3B1 CRISPR/Cas9 KO Plasmid (h): sc-409765

Übersicht

HS3ST3B1 kodiert die Heparansulfat-Glucosamin-3-O-Sulfotransferase 3B1, ein im Golgi-Apparat lokalisiertes Enzym, das die 3-O-Sulfatierung von Heparansulfat-Ketten katalysiert. Diese Modifikation trägt dazu bei, Bindungsstellen von Heparansulfat für extrazelluläre Liganden zu definieren, und prägt die Signal-Mikroumgebungen an der Zelloberfläche und in der extrazellulären Matrix. Durch die Modulation der Feinstruktur von Heparansulfat kann HS3ST3B1 Prozesse beeinflussen, darunter die Signalübertragung von Wachstumsfaktoren und Chemokinen, Zell-Zell-Interaktionen sowie adhäsionsabhängige Migration. Veränderte Sulfatierungsmuster von Heparansulfat sind mit fehlregulierten Signalnetzwerken assoziiert, die in der Krebsbiologie, bei Entzündungen und beim Gewebeumbau eine Rolle spielen, was HS3ST3B1 zu einem nützlichen Ziel für mechanistische Studien glycosaminoglykanabhängiger Signalwege macht.

Das HS3ST3B1 CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (h) ist ein Pool von Plasmiden, die für die gezielte Disruption des HS3ST3B1-Gens in human-Zelllinien entwickelt wurden. Jedes Plasmid koexprimiert eine einzigartige Single-Guide-RNA (sgRNA), die auf eine bestimmte Stelle innerhalb des HS3ST3B1-Gens abzielt, zusammen mit der Streptococcus pyogenes Cas9-Nuklease. Die Plasmide kodieren zudem für GFP, was die fluoreszente Identifizierung und Anreicherung erfolgreich transfizierter Zellen mittels Fluoreszenzmikroskopie oder Durchflusszytometrie ermöglicht.

Das Multi-Guide-Design erhöht die Wahrscheinlichkeit, dass Insertionen oder Deletionen (Indels) entstehen, die den offenen Leserahmen von HS3ST3B1 nach der Cas9-vermittelten Bildung von Doppelstrangbrüchen unterbrechen. Durch das CRISPR/Cas9-System verursachte DNA-Brüche werden über endogene NHEJ-Wege (Non-Homologous End Joining) repariert, was häufig zu Frameshift-Mutationen führt, die die HS3ST3B1-Proteinexpression aufheben.

Dieses CRISPR-Knockout-System ermöglicht die effiziente Erzeugung von HS3ST3B1-defizienten Zellmodellen zur Untersuchung der HS3ST3B1-Signalübertragung, für funktionelle Genomstudien, in der Krebsbiologieforschung sowie zur Bewertung therapeutischer Reaktionen in menschlichen Zelllinien.

Hauptmerkmale

• sgRNAs, die auf HS3ST3B1-Exone abzielen, die für die HS3ST3B1-Funktion entscheidend sind
  Ko-Expression von SpCas9 und sgRNA aus einem einzigen Plasmid zur vereinfachten Verabreichung
  GFP-Reporter zur Identifizierung transfizierter Zellen
  Pool von Plasmiden, die auf mehrere HS3ST3B1-Genomstellen abzielen, um die Knockout-Effizienz zu verbessern
  Kompatibel mit der Verabreichung durch Transfektion

Designvarianten

CRISPRs +/- HDRs

• gRNAs, die vom HS3ST3B1 CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (h) und vom HS3ST3B1 CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (h2) kodiert werden, zielen auf unterschiedliche Stellen innerhalb des HS3ST3B1-Lokus ab. Es kann ein oder beide Targeting-Designs verfügbar sein. Siehe „Verwandte Produkte“ für Verfügbarkeit.
  HDR-Donorkonstrukte, kodiert durch das HS3ST3B1 HDR-Plasmid (h) und HS3ST3B1 HDR-Plasmid (h2) kodiert, enthalten eine Puromycin-Resistenzkassette und einen RFP-Reporter, flankiert von HS3ST3B1-Homologiearmen, um die homologe Reparatur an definierten HS3ST3B1-Zielstellen entsprechend den CRISPR/Cas9-KO-Designs zu unterstützen. Die Verfügbarkeit von HDR-Donoren kann variieren. Siehe „Verwandte Produkte“ für Verfügbarkeit.

Nur für Forschungszwecke. Nicht für diagnostische oder therapeutische Zwecke bestimmt.