HoxD12 CRISPR/Cas9 케이오 플라스미드 (h): sc-407472

개요

HOXD12는 홈박스 전사인자 HoxD12를 암호화하며, 배아 발생 동안 위치 정체성을 확립하고 사지 및 체축 골격의 패터닝을 조율하는 HOXD 클러스터의 구성원입니다. DNA 결합 조절자로서 HoxD12는 더 광범위한 HOX 조절 네트워크 및 염색질 수준의 조절과 통합되어, 분화와 형태형성을 관장하는 조직 특이적 전사 프로그램을 형성합니다. HOXD12 발현의 이상 조절 또는 HOX 클러스터 조절의 교란은 발달 이상과 연관되어 왔고, 여러 암에서 전사체 시그니처로 보고되기도 했는데, 이는 계통(lineage) 및 성장 관련 유전자 네트워크를 제어하는 역할을 반영합니다. 성체 및 질환 맥락에서 HOXD12 활성이 변하면 세포 상태 전환, 이동 프로그램, 발달 경로의 재활성화에 영향을 줄 수 있습니다.

HoxD12 CRISPR/Cas9 KO 플라스미드 (h)는 human 세포주에서 HOXD12 유전자의 표적 파괴를 위해 설계된 플라스미드 풀입니다. 각 플라스미드는 HOXD12 유전자 내의 서로 다른 부위를 표적으로 하는 고유한 단일 가이드 RNA(sgRNA)와 Streptococcus pyogenes Cas9 뉴클레아제를 함께 발현합니다. 또한 이 플라스미드들은 GFP를 암호화하여, 형광 현미경이나 유세포 분석기를 통해 성공적으로 형질전환된 세포를 형광으로 식별하고 농축할 수 있게 합니다.

다중 가이드 설계는 Cas9에 의한 이중 가닥 절단 형성 후 HOXD12의 개방 독서 틀(ORF)을 파괴하는 삽입 또는 결실(indel)이 발생할 가능성을 높입니다. CRISPR/Cas9 시스템에 의해 유발된 DNA 절단은 내인성 비동종 말단 결합(NHEJ) 경로를 통해 복구되며, 이는 종종 HoxD12 단백질 발현을 소멸시키는 프레임 시프트 돌연변이를 초래합니다.

이 CRISPR 녹아웃 시스템은 HoxD12 신호 전달 연구, 기능 유전체학 연구, 암 생물학 연구 및 인간 세포주에서의 치료 반응 평가를 위한 HOXD12 결핍 세포 모델을 효율적으로 생성할 수 있게 합니다.

주요 특징

• HoxD12 기능에 중요한 HOXD12 엑손을 표적하는 sgRNA
  전달을 단순화하기 위해 단일 플라스미드에서 SpCas9 및 sgRNA의 공동 발현
  형질전환된 세포 식별을 위한 GFP 리포터
  녹아웃 효율 향상을 위해 여러 HOXD12 게놈 부위를 표적하는 플라스미드 풀
  형질전환을 통한 전달과 호환

설계 변형

CRISPRs +/- HDR

• HoxD12 CRISPR/Cas9 KO 플라스미드 (h) 및 HoxD12 CRISPR/Cas9 KO 플라스미드 (h2)에 의해 암호화되는 gRNA는 HOXD12 유전자좌 내의 서로 다른 부위를 표적화합니다. 표적화 설계 중 하나 또는 둘 다 이용 가능할 수 있습니다. 구입 가능 여부는 관련 제품을 참조하십시오.
  HoxD12 HDR 플라스미드 (h) 및 HoxD12 HDR 플라스미드 (h2)에 의해 암호화되는
  HDR 기증자 컨스트럭트는 푸로마이신 내성 카세트와 RFP 리포터를 포함하며, 이는 CRISPR/Cas9 KO 설계에 해당하는 정의된 HOXD12 표적 부위에서의 상동성 유도 복구를 지원하기 위해 HOXD12 상동성 암으로 둘러싸여 있습니다. HDR 기증자의 재고 여부는 달라질 수 있습니다. 재고 여부는 관련 제품을 참조하십시오.

연구용으로만 사용하세요. 진단 또는 치료용이 아닙니다.