hnRNP C1/C2 CRISPR/Cas9 KO Plasmid (m): sc-420894

Übersicht

Hnrnpc kodiert das heterogene nukleäre Ribonukleoprotein C1/C2 (hnRNP C1/C2), reichlich vorhandene nukleäre RNA-bindende Proteine, die sich an Prä‑mRNAs anlagern, um neu entstehende Transkripte zu verpacken und das Schicksal der RNA zu bestimmen. hnRNP C ist an der kotranskriptionellen Auswahl von Spleißstellen, der 3′‑Endprozessierung von mRNA sowie an Entscheidungen über nukleären Verbleib bzw. Export beteiligt und trägt zur Integrität des Transkriptoms bei, indem es einer unangebrachten Alu-Exonisierung und anderen kryptischen Spleißereignissen entgegenwirkt. Über diese Funktionen ist Hnrnpc in zentrale Wege des RNA‑Stoffwechsels eingebunden und beeinflusst Genexpressionsprogramme, die mit Proliferation, Differenzierung und zellulären Stressantworten verknüpft sind. Eine Fehlregulation von hnRNP C wurde in der Literatur mit veränderten Spleißlandschaften in Krebs- und neurodegenerationsrelevanten Modellen in Zusammenhang gebracht, was es zu einem häufigen Knotenpunkt für die Untersuchung von Defekten in der RNA‑Prozessierung macht.

Das hnRNP C1/C2 CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (m) ist ein Pool von Plasmiden, die für die gezielte Disruption des Hnrnpc-Gens in mouse-Zelllinien entwickelt wurden. Jedes Plasmid koexprimiert eine einzigartige Single-Guide-RNA (sgRNA), die auf eine bestimmte Stelle innerhalb des Hnrnpc-Gens abzielt, zusammen mit der Streptococcus pyogenes Cas9-Nuklease. Die Plasmide kodieren zudem für GFP, was die fluoreszente Identifizierung und Anreicherung erfolgreich transfizierter Zellen mittels Fluoreszenzmikroskopie oder Durchflusszytometrie ermöglicht.

Das Multi-Guide-Design erhöht die Wahrscheinlichkeit, dass Insertionen oder Deletionen (Indels) entstehen, die den offenen Leserahmen von Hnrnpc nach der Cas9-vermittelten Bildung von Doppelstrangbrüchen unterbrechen. Durch das CRISPR/Cas9-System verursachte DNA-Brüche werden über endogene NHEJ-Wege (Non-Homologous End Joining) repariert, was häufig zu Frameshift-Mutationen führt, die die hnRNP C1/C2-Proteinexpression aufheben.

Dieses CRISPR-Knockout-System ermöglicht die effiziente Erzeugung von Hnrnpc-defizienten Zellmodellen zur Untersuchung der hnRNP C1/C2-Signalübertragung, für funktionelle Genomstudien, in der Krebsbiologieforschung sowie zur Bewertung therapeutischer Reaktionen in menschlichen Zelllinien.

Hauptmerkmale

• sgRNAs, die auf Hnrnpc-Exone abzielen, die für die hnRNP C1/C2-Funktion entscheidend sind
  Ko-Expression von SpCas9 und sgRNA aus einem einzigen Plasmid zur vereinfachten Verabreichung
  GFP-Reporter zur Identifizierung transfizierter Zellen
  Pool von Plasmiden, die auf mehrere Hnrnpc-Genomstellen abzielen, um die Knockout-Effizienz zu verbessern
  Kompatibel mit der Verabreichung durch Transfektion

Designvarianten

CRISPRs +/- HDRs

• gRNAs, die vom hnRNP C1/C2 CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (m) und vom hnRNP C1/C2 CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (m2) kodiert werden, zielen auf unterschiedliche Stellen innerhalb des Hnrnpc-Lokus ab. Es kann ein oder beide Targeting-Designs verfügbar sein. Siehe „Verwandte Produkte“ für Verfügbarkeit.
  HDR-Donorkonstrukte, kodiert durch das hnRNP C1/C2 HDR-Plasmid (m) und hnRNP C1/C2 HDR-Plasmid (m2) kodiert, enthalten eine Puromycin-Resistenzkassette und einen RFP-Reporter, flankiert von Hnrnpc-Homologiearmen, um die homologe Reparatur an definierten Hnrnpc-Zielstellen entsprechend den CRISPR/Cas9-KO-Designs zu unterstützen. Die Verfügbarkeit von HDR-Donoren kann variieren. Siehe „Verwandte Produkte“ für Verfügbarkeit.

Nur für Forschungszwecke. Nicht für diagnostische oder therapeutische Zwecke bestimmt.