HMG-20A Plasmide KO CRISPR/Cas9 (h): sc-407302

Panoramica

HMG20A codifica HMG-20A, un fattore associato alla cromatina di tipo High Mobility Group che contribuisce alla regolazione trascrizionale influenzando l’organizzazione dei nucleosomi e l’accesso dei complessi regolatori al DNA. È stato implicato nel controllo epigenetico dei programmi di linea cellulare, inclusa l’espressione genica neuro-sviluppativa, tramite interazioni con i macchinari di rimodellamento della cromatina e di modifica degli istoni. Modulando l’attività di promotori ed enhancer, HMG-20A può influenzare il controllo del ciclo cellulare, la differenziazione e il mantenimento dell’identità cellulare. Un’alterata regolazione degli stati della cromatina associati a HMG20A è rilevante negli studi sui fenotipi neurologici e sulla disregolazione trascrizionale associata al cancro.

Il plasmide CRISPR/Cas9 KO HMG-20A (h) è un pool di plasmidi progettato per la distruzione mirata del gene HMG20A in linee cellulari human. Ciascun plasmide co-esprime un singolo RNA guida (sgRNA) unico che prende di mira un sito distinto all'interno del HMG20A insieme alla nucleasi Cas9 di Streptococcus pyogenes. I plasmidi codificano anche per la GFP, consentendo l'identificazione fluorescente e l'arricchimento delle cellule trasfettate con successo tramite microscopia a fluorescenza o citometria a flusso.

Il design multi-guida aumenta la probabilità di generare inserzioni o delezioni (indels) che interrompono il frame di lettura aperto HMG20A a seguito della formazione di rotture a doppio filamento mediate da Cas9. Le rotture del DNA introdotte dal sistema CRISPR/Cas9 vengono riparate attraverso vie endogene di giunzione non omologa (NHEJ), che spesso provocano mutazioni con spostamento del frame che annullano l'espressione della proteina HMG-20A.

Questo sistema di knockout CRISPR consente la generazione efficiente di modelli cellulari carenti di HMG20A per lo studio della segnalazione di HMG-20A, studi di genomica funzionale, ricerca sulla biologia del cancro e valutazione delle risposte terapeutiche in linee cellulari umane.

Caratteristiche principali

• sgRNA mirati agli esoni HMG20A critici per la funzione di HMG-20A
  Co-espressione di SpCas9 e sgRNA da un singolo plasmide per una somministrazione semplificata
  Reporter GFP per l'identificazione delle cellule trasfettate
  Pool di plasmidi mirati a più siti genomici di HMG20A per migliorare l'efficienza del knockout
  Compatibile con la somministrazione tramite trasfezione

Varianti di progettazione

CRISPR +/- HDR

• Gli gRNA codificati dal HMG-20A CRISPR/Cas9 KO Plasmid (h) e dal HMG-20A CRISPR/Cas9 KO Plasmid (h2) prendono di mira siti distinti all'interno del locus HMG20A. Potrebbe essere disponibile uno o entrambi i design di targeting. Vedere Prodotti correlati per la disponibilità.
  I costrutti donatori HDR codificati dal HMG-20A Plasmide HDR (h) e il plasmide HDR HMG-20A (h2) contengono una cassetta di resistenza alla puromicina e un reporter RFP affiancato da bracci di omologia HMG20A per supportare la riparazione diretta dall'omologia in siti bersaglio HMG20A definiti corrispondenti ai disegni CRISPR/Cas9 KO. La disponibilità dei donatori HDR può variare. Vedere Prodotti correlati per la disponibilità.

Solo per uso di ricerca. Non destinato a uso diagnostico o terapeutico.