HCF1 CRISPR/Cas9 KO Plasmid (h): sc-403097

Übersicht

HCFC1 kodiert den Host-Cell-Factor 1 (HCF1), einen chromatinassoziierten transkriptionellen Koregulator, der sequenzspezifische Transkriptionsfaktoren mit histonmodifizierenden Komplexen verbindet, um Genexpressionsprogramme zu koordinieren, die für Zellzyklusprogression und zelluläre Identität erforderlich sind. HCF1 ist an der epigenetischen Kontrolle von Promotoren und Enhancern beteiligt und unterstützt Signalwege, die mit dem G1/S-Übergang, der Kompetenz zur DNA-Replikation und der Homöostase der Transkription verknüpft sind. Eine Störung der HCFC1-Funktion wurde mit neuroentwicklungsbezogenen Phänotypen und X-chromosomal verknüpfter intellektueller Beeinträchtigung in Zusammenhang gebracht; veränderte HCF1-abhängige Transkriptionsnetzwerke werden zudem im Kontext onkogener Proliferation untersucht. Als Knotenpunkt für Chromatin-Remodelling und die Assemblierung von Transkriptionsfaktoren wird HCF1 häufig in Studien zur Promotorregulation, Zellzykluskontrolle und zu genomweiten Schaltkreisen der Genexpression untersucht.

Das HCF1 CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (h) ist ein Pool von Plasmiden, die für die gezielte Disruption des HCFC1-Gens in human-Zelllinien entwickelt wurden. Jedes Plasmid koexprimiert eine einzigartige Single-Guide-RNA (sgRNA), die auf eine bestimmte Stelle innerhalb des HCFC1-Gens abzielt, zusammen mit der Streptococcus pyogenes Cas9-Nuklease. Die Plasmide kodieren zudem für GFP, was die fluoreszente Identifizierung und Anreicherung erfolgreich transfizierter Zellen mittels Fluoreszenzmikroskopie oder Durchflusszytometrie ermöglicht.

Das Multi-Guide-Design erhöht die Wahrscheinlichkeit, dass Insertionen oder Deletionen (Indels) entstehen, die den offenen Leserahmen von HCFC1 nach der Cas9-vermittelten Bildung von Doppelstrangbrüchen unterbrechen. Durch das CRISPR/Cas9-System verursachte DNA-Brüche werden über endogene NHEJ-Wege (Non-Homologous End Joining) repariert, was häufig zu Frameshift-Mutationen führt, die die HCF1-Proteinexpression aufheben.

Dieses CRISPR-Knockout-System ermöglicht die effiziente Erzeugung von HCFC1-defizienten Zellmodellen zur Untersuchung der HCF1-Signalübertragung, für funktionelle Genomstudien, in der Krebsbiologieforschung sowie zur Bewertung therapeutischer Reaktionen in menschlichen Zelllinien.

Hauptmerkmale

• sgRNAs, die auf HCFC1-Exone abzielen, die für die HCF1-Funktion entscheidend sind
  Ko-Expression von SpCas9 und sgRNA aus einem einzigen Plasmid zur vereinfachten Verabreichung
  GFP-Reporter zur Identifizierung transfizierter Zellen
  Pool von Plasmiden, die auf mehrere HCFC1-Genomstellen abzielen, um die Knockout-Effizienz zu verbessern
  Kompatibel mit der Verabreichung durch Transfektion

Designvarianten

CRISPRs +/- HDRs

• gRNAs, die vom HCF1 CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (h) und vom HCF1 CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (h2) kodiert werden, zielen auf unterschiedliche Stellen innerhalb des HCFC1-Lokus ab. Es kann ein oder beide Targeting-Designs verfügbar sein. Siehe „Verwandte Produkte“ für Verfügbarkeit.
  HDR-Donorkonstrukte, kodiert durch das HCF1 HDR-Plasmid (h) und HCF1 HDR-Plasmid (h2) kodiert, enthalten eine Puromycin-Resistenzkassette und einen RFP-Reporter, flankiert von HCFC1-Homologiearmen, um die homologe Reparatur an definierten HCFC1-Zielstellen entsprechend den CRISPR/Cas9-KO-Designs zu unterstützen. Die Verfügbarkeit von HDR-Donoren kann variieren. Siehe „Verwandte Produkte“ für Verfügbarkeit.

Nur für Forschungszwecke. Nicht für diagnostische oder therapeutische Zwecke bestimmt.