GDPD3 Plásmido CRISPR/Cas9 KO (h): sc-405288

Descripción general

GDPD3 (dominio que contiene 3 de la glicerofofodiéster fosfodiesterasa) es una glicerofosfodiesterasa humana implicada en el catabolismo de fosfolípidos y en la remodelación de glicerofosfolípidos, procesos que determinan la composición de las membranas y la señalización derivada de lípidos. Al hidrolizar glicerofosfodiésteres, GDPD3 puede influir en los reservorios celulares de metabolitos que sustentan el tráfico de membranas, la homeostasis de los orgánulos y redes metabólicas lipídicas más amplias. La regulación alterada del metabolismo de glicerofosfolípidos se asocia con frecuencia a cambios en la proliferación, la adaptación al estrés y la señalización relacionada con el sistema inmunitario, lo que convierte a GDPD3 en un nodo relevante para estudios mecanísticos sobre reprogramación metabólica. Se han descrito cambios en la expresión y la actividad de enzimas lipídicas, incluida GDPD3, en diversos contextos relevantes para enfermedades, lo que respalda la investigación de su contribución a la desregulación de la homeostasis lipídica.

El plásmido CRISPR/Cas9 KO GDPD3 (h) es un conjunto de plásmidos diseñado para la interrupción dirigida del gen GDPD3 en líneas celulares human. Cada plásmido coexpresa un ARN guía único (sgRNA) dirigido a un sitio distinto dentro del GDPD3 junto con la nucleasa Cas9 de Streptococcus pyogenes. Los plásmidos también codifican GFP, lo que permite la identificación fluorescente y el enriquecimiento de las células transfectadas con éxito mediante microscopía de fluorescencia o citometría de flujo.

El diseño multiguía aumenta la probabilidad de generar inserciones o deleciones (indeles) que interrumpan el marco de lectura abierto de GDPD3 tras la formación de roturas de doble cadena mediadas por Cas9. Las roturas de ADN introducidas por el sistema CRISPR/Cas9 se reparan a través de vías endógenas de unión de extremos no homólogos (NHEJ), lo que con frecuencia da lugar a mutaciones de desplazamiento del marco de lectura que anulan la expresión de la proteína GDPD3.

Este sistema de knockout CRISPR permite la generación eficiente de modelos celulares deficientes en GDPD3 para la investigación de la señalización de GDPD3, estudios de genómica funcional, investigación en biología del cáncer y evaluación de respuestas terapéuticas en líneas celulares humanas.

Características principales

• sgRNA dirigidos a los exones de GDPD3 críticos para la función de GDPD3
  Coexpresión de SpCas9 y sgRNA a partir de un único plásmido para simplificar la administración
  Reportero GFP para la identificación de células transfectadas
  Conjunto de plásmidos dirigidos a múltiples sitios genómicos de GDPD3 para mejorar la eficiencia del knockout
  Compatible con la administración mediante transfección

Variantes de diseño

CRISPRs +/- HDRs

• Los gRNA codificados por el plásmido GDPD3 CRISPR/Cas9 KO (h) y el plásmido GDPD3 CRISPR/Cas9 KO (h2) se dirigen a sitios distintos dentro del locus GDPD3. Puede estar disponible uno o ambos diseños de orientación. Consulte «Productos relacionados» para conocer la disponibilidad.
  Las construcciones donantes HDR codificadas por el plásmido HDR GDPD3 (h) y el plásmido HDR GDPD3 (h2) contienen un casete de resistencia a la puromicina y un reportero RFP flanqueado por brazos de homología GDPD3 para facilitar la reparación dirigida por homología en sitios diana GDPD3 definidos que se corresponden con los diseños de KO de CRISPR/Cas9. La disponibilidad de los donantes HDR puede variar. Consulte «Productos relacionados» para conocer la disponibilidad.

Sólo para uso en investigación. No destinado a uso diagnóstico o terapéutico.