Nicht CRISPR-Daten: Das Bild veranschaulicht die Qualität von Antikörpern zur Visualisierung von CRISPR-Experimentergebnissen.
Nicht CRISPR-Daten: Das Bild veranschaulicht die Qualität von Antikörpern zur Visualisierung von CRISPR-Experimentergebnissen.
GATA-6 Double Nickase Plasmid (h): sc-400724-NIC
- Zielspezies: human
- 20 µg transfektionsfertige, aufgereinigte Plasmid DNA; geeignet für 20 Transfektionen
- Das GATA-6 Double Nickase Plasmid (h) wird als Plasmid-Paar geliefert. Die einzelnen Plasmide kodieren für eine D10A mutierte Cas9 Nuklease sowie für je eine unterschiedliche, zielspezifische 20nt guide RNA (gRNA) Sequenz. Dies erlaubt eine hohe Knockout-Effizienz bei gleichzeitig größerer Spezifität als das entsprechende CRISPR/Cas9 KO Plasmid
- gRNA Sequenzpaare liegen ca. 20 bp auseinander um ein spezifisches Cas9-vermitteltes "Double Nicking" der genomischen DNA zu erlauben und so im Resultat den Effekt eines Doppelstrangbruchs nachzuahmen.
- Ein Plasmid kodiert für ein Puromycin-Resistenzgen zur Selektion von stabilen Knockout-Zellen. Das andere Plasmid kodiert für ein GFP-Gen für den visuellen Nachweis der Transfektion
- GATA-6 Double-Nickase-Plasmid (h) und GATA-6 Double-Nickase-Plasmid (h2) kodieren unterschiedliche gepaarte gRNA-Designs, die auf GATA6 abzielen. Möglicherweise ist eines oder sind beide Designs verfügbar
- Nach der Transfektion kann die Effizienz des Gen-Knockouts per Western Blot oder histologisch mit folgendem Antikörper überprüft werden: GATA-6: sc-517554
Bestellinformation
| Produkt | Katalog # | EINHEIT | Preis | ANZAHL | Favoriten | |
GATA-6 Double Nickase Plasmid (h) | sc-400724-NIC | 20 µg | $410.00 | |||
GATA-6 Double Nickase Plasmid (h2) | sc-400724-NIC-2 | 20 µg | $410.00 |
GATA6 kodiert den Zinkfinger-Transkriptionsfaktor GATA-6, einen lineagedefinierenden Regulator der endodermalen und mesodermalen Differenzierung, der Gen-Netzwerke steuert, die an der Organogenese, epithelialen Identität und Programmen der glatten Muskulatur beteiligt sind. In menschlichen Zellen integriert GATA-6 entwicklungsbiologische Signaleingänge, um transkriptionelle Schaltkreise zu modulieren, die Proliferation, Migration und die Festlegung des Zellschicksals regulieren, einschließlich Signalwege, die mit Wnt-, BMP- und Notch-abhängiger Musterbildung verknüpft sind. Eine fehlregulierte GATA6-Expression oder Veränderungen der Kopienzahl wurden mit angeborenen Entwicklungsdefekten sowie kontextabhängigen onkogenen oder tumorunterdrückenden transkriptionellen Zuständen in gastrointestinalen, pankreatischen und pulmonalen Linien in Verbindung gebracht. Diese Eigenschaften machen GATA-6 zu einem nützlichen Knotenpunkt, um die transkriptionelle Kontrolle von Differenzierung, Linienplastizität und stressadaptivem Remodeling in krankheitsrelevanten Modellen zu untersuchen.
GATA-6 Das Double-Nickase-Plasmid (h) besteht aus einem aufeinander abgestimmten Plasmidpaar, das für die hochspezifische Bearbeitung des GATA6-Lokus in human-Zelllinien entwickelt wurde. Jedes Plasmid exprimiert eine Cas9-D10A-Nickase und eine spezifische sgRNA, die auf entgegengesetzte DNA-Stränge innerhalb von GATA6 abzielt. Wenn sie auf benachbarte Stellen auf entgegengesetzten DNA-Strängen gerichtet sind, erzeugen die beiden Nickasen versetzte Einzelstrang-Schnitte, die zusammen einen versetzten Doppelstrangbruch erzeugen, was eine koordinierte On-Target-Aktivität beider Guides erfordert. Der resultierende DNA-Bruch wird durch endogene zelluläre Reparaturwege behoben, meist durch nicht-homologe Endverknüpfung (NHEJ), was zu Insertionen oder Deletionen führt, die die GATA6-Funktion stören. Durch die Notwendigkeit einer doppelten sgRNA-Bindung am Zielort erhöht der Doppel-Nick-Ansatz die Spezifität der Bearbeitung und bietet eine komplementäre CRISPR-Strategie für Anwendungen, bei denen eine zusätzliche Kontrolle über die Zielgenauigkeit gewünscht ist.
Um eine effiziente Identifizierung editierter Zellen zu unterstützen, kodiert ein Plasmid GFP zur fluoreszierenden Visualisierung transfizierter Populationen, während das Begleitplasmid ein Puromycin-Resistenzgen für die Antibiotika-Selektion trägt. Zusammen unterstützen diese Merkmale eine effiziente Anreicherung co-transfizierter Populationen und vereinfachen die Validierung von Klonen mit GATA6-Störung.
Nur für Forschungszwecke. Nicht für diagnostische oder therapeutische Zwecke bestimmt.