Plasmide CRISPR/Cas9 KO FAM188B (h): sc-413571

Présentation

FAM188B code une protéine humaine encore mal caractérisée, impliquée dans la régulation de l’homéostasie protéique et de la signalisation, possiblement via des associations avec le renouvellement dépendant de l’ubiquitine et les réseaux de protéostase. Des données émergentes relient FAM188B à la prolifération cellulaire et aux réponses adaptatives au stress, suggérant un rôle dans des voies qui coordonnent la progression du cycle cellulaire, les signaux de survie et l’adaptation à des conditions protéotoxiques. Des profils d’expression altérés ont été rapportés dans plusieurs types de tumeurs, ce qui étaye l’étude de FAM188B comme modulateur de phénotypes oncogéniques et de vulnérabilités dépendantes du contexte. Malgré une définition mécanistique encore limitée, FAM188B constitue une cible utile pour comprendre comment la régulation du protéome s’articule avec le contrôle de la croissance et la fitness cellulaire.

Le plasmide CRISPR/Cas9 KO FAM188B (h) est un ensemble de plasmides conçus pour la disruption ciblée du gène FAM188B dans les lignées cellulaires human. Chaque plasmide co-exprime un ARN guide unique (sgRNA) ciblant un site distinct au sein du FAM188B, ainsi que la nucléase Cas9 de Streptococcus pyogenes. Les plasmides codent également pour la GFP, ce qui permet l'identification par fluorescence et l'enrichissement des cellules transfectées avec succès par microscopie à fluorescence ou cytométrie en flux.

La conception multi-guide augmente la probabilité de générer des insertions ou des délétions (indels) qui perturbent le cadre de lecture ouvert FAM188B à la suite de la formation de cassures double brin médiées par Cas9. Les cassures d'ADN introduites par le système CRISPR/Cas9 sont réparées par des voies endogènes de jonction non homologue (NHEJ), ce qui entraîne fréquemment des mutations par décalage du cadre de lecture qui suppriment l'expression de la protéine FAM188B.

Ce système de knock-out CRISPR permet la génération efficace de modèles cellulaires déficients en FAM188B pour l'étude de la signalisation de FAM188B, les études de génomique fonctionnelle, la recherche en biologie du cancer et l'évaluation des réponses thérapeutiques dans des lignées cellulaires humaines.

Caractéristiques principales

• sgRNA ciblant le ou les exons de FAM188B essentiels à la fonction de FAM188B
  Co-expression de SpCas9 et de sgRNA à partir d'un seul plasmide pour une administration simplifiée
  Rapporteur GFP pour l'identification des cellules transfectées
  Pool de plasmides ciblant plusieurs sites génomiques de FAM188B pour améliorer l'efficacité du knock-out
  Compatible avec l'administration par transfection

Variantes de conception

CRISPR +/- HDR

• Les gRNA codés par le FAM188B plasmide CRISPR/Cas9 KO (h) et le FAM188B plasmide CRISPR/Cas9 KO (h2) ciblent des sites distincts au sein du locus FAM188B. Une ou les deux conceptions de ciblage peuvent être disponibles. Voir les produits associés pour connaître la disponibilité.
  Les constructions donneuses HDR codées par le FAM188B plasmide HDR (h) et le FAM188B (h2) contiennent une cassette de résistance à la puromycine et un rapporteur RFP flanqué de bras d'homologie FAM188B pour permettre la réparation dirigée par homologie au niveau de sites cibles FAM188B définis correspondant aux conceptions CRISPR/Cas9 KO. La disponibilité des donneurs HDR peut varier. Voir les produits associés pour connaître la disponibilité.

Réservé à la recherche. N'est pas destiné à un usage diagnostique ou thérapeutique.