DDX21 CRISPR/Cas9 KOプラスミド (h2): sc-405770-KO-2

概要

DDX21は核小体に局在するDEADボックス型RNAヘリカーゼであり、RNA‐タンパク質複合体を再構成することで、rRNAプロセシング、リボソーム生合成、さらに広範なRNA代謝を統合的に制御します。核小体ストレス応答にも関与し、増殖シグナルをタンパク質合成能へと結び付ける転写プログラムと連携して、細胞周期の進行やプロテオスタシスに影響を与えます。またDDX21は、RNA依存性経路やインターフェロン刺激遺伝子の発現を調節することにより、自然免疫シグナル伝達にも関与すると報告されています。DDX21機能の破綻やリボソーム生合成の異常は、がん化、ゲノムストレス、ウイルス感染の生物学といった文脈で頻繁に研究されています。

DDX21 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h2）は、human細胞株におけるDDX21遺伝子の標的破壊を目的として設計されたプラスミドのプールである。各プラスミドは、DDX21内の異なる部位を標的とする固有のシングルガイドRNA（sgRNA）と、Streptococcus pyogenes由来のCas9ヌクレアーゼを共発現します。また、これらのプラスミドはGFPをコードしており、蛍光顕微鏡やフローサイトメトリーを用いて、トランスフェクションに成功した細胞を蛍光で識別・濃縮することが可能です。

このマルチガイド設計により、Cas9による二本鎖切断の形成後に、DDX21のオープンリーディングフレームを破壊する挿入または欠失（インデル）が生じる可能性が高まります。CRISPR/Cas9システムによって導入されたDNA切断は、内因性の非相同末端結合（NHEJ）経路を通じて修復され、その結果、DDX21タンパク質の発現を阻害するフレームシフト変異が生じることが頻繁にあります。

このCRISPRノックアウトシステムにより、DDX21シグナル伝達、機能ゲノミクス研究、がん生物学研究、およびヒト細胞株における治療反応の評価を目的とした、DDX21欠損細胞モデルの効率的な作製が可能となる。

主な特徴

• DDX21の機能に不可欠なDDX21エクソンを標的とするsgRNA
  導入を簡素化するための、単一プラスミドからのSpCas9およびsgRNAの共発現
  トランスフェクトされた細胞を識別するためのGFPレポーター
  ノックアウト効率を向上させるための、DDX21ゲノム上の複数の部位を標的とするプラスミドのプール
  トランスフェクションによる導入に対応

設計バリエーション

CRISPRs +/- HDR

• DDX21 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h）およびDDX21 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h2）によってコードされるgRNAは、DDX21遺伝子座内の異なる部位を標的としています。いずれか一方、または両方の標的設計が利用可能な場合があります。入手可能性については「関連製品」を参照してください。
  DDX21 HDRプラスミド（h）および DDX21 HDRプラスミド（h2）によってコードされるHDRドナー構築体は、プロマイシン耐性カセットとRFPレポーターを含み、これらはDDX21ホモロジーアームに挟まれており、CRISPR/Cas9 KO設計に対応する特定のDDX21標的部位でのホモロジー依存修復をサポートします。HDRドナーの入手可能性は異なる場合があります。入手可能性については「関連製品」をご確認ください。

研究用のみ。診断用または治療用ではありません。