Non dati CRISPR: l'immagine illustra la qualità degli anticorpi per la visualizzazione dei risultati degli esperimenti CRISPR.
Non dati CRISPR: l'immagine illustra la qualità degli anticorpi per la visualizzazione dei risultati degli esperimenti CRISPR.
CXXC5 Plasmide KO CRISPR/Cas9 (h): sc-403248
- Specie Target: human
- 20 µg di DNA plasmidico purificato, pronto per trasfezione; sufficiente fino a 20 trasfezioni
- CXXC5 Il plasmide CRISPR/Cas9 Knockout (KO) (h) è un pool di plasmidi, ciascuno dei quali codifica la nucleasi Cas9 e un RNA guida (gRNA) specifico per il bersaglio di 20 nt, progettato per la massima efficienza di knockout utilizzando sequenze derivate dalla libreria GeCKO v2
- Le sequenze gRNA indirizzano Cas9 a indurre rotture a doppio filamento (DSB) sito-specifiche nel locus genomico CXXC5, con conseguente knockout genico tramite giunzione non omologa (NHEJ)
- I geni di resistenza alla puromicina e RFP sono fiancheggiati da siti LoxP, consentendo la rimozione dei marcatori di selezione tramite la ricombinasi Cre (Cre Vector: sc-418923) dopo aver stabilito linee cellulari knockout stabili
- In seguito alla trasfezione, l'efficienza dll'attivazione genica può essere testata con WB, IF o IHC utilizzando l'anticorpo: CXXC5 Antibody (H-6): sc-376348
Informazioni ordini
| Nome del prodotto | Codice del prodotto | UNITÀ | Prezzo | Quantità | Preferiti | |
CXXC5 Plasmide KO CRISPR/Cas9 (h) | sc-403248 | 20 µg | $397.00 |
Panoramica
CXXC5 (proteina 5 a dita di zinco di tipo CXXC) è un regolatore nucleare e citoplasmatico che si lega al DNA ricco di CpG tramite il suo dominio CXXC e interagisce con il controllo epigenetico della trascrizione. Agisce come modulatore dipendente dal contesto della segnalazione Wnt/β-catenina e partecipa a vie che governano le decisioni sul destino cellulare, la proliferazione e la differenziazione, con ruoli riportati nei programmi ematopoietici e neurali. CXXC5 collega inoltre la segnalazione mediata da fattori di crescita e dallo stress agli output trascrizionali, influenzando processi associati alla cromatina e la dinamica dell’espressione genica. Un’espressione deregolata di CXXC5 è stata associata a una segnalazione Wnt aberrante e a stati di differenziazione alterati osservati in molteplici contesti rilevanti per la malattia, sostenendone lo studio nei meccanismi dello sviluppo e della segnalazione oncogenica.
Il plasmide CRISPR/Cas9 KO CXXC5 (h) è un pool di plasmidi progettato per la distruzione mirata del gene CXXC5 in linee cellulari human. Ciascun plasmide co-esprime un singolo RNA guida (sgRNA) unico che prende di mira un sito distinto all'interno del CXXC5 insieme alla nucleasi Cas9 di Streptococcus pyogenes. I plasmidi codificano anche per la GFP, consentendo l'identificazione fluorescente e l'arricchimento delle cellule trasfettate con successo tramite microscopia a fluorescenza o citometria a flusso.
Il design multi-guida aumenta la probabilità di generare inserzioni o delezioni (indels) che interrompono il frame di lettura aperto CXXC5 a seguito della formazione di rotture a doppio filamento mediate da Cas9. Le rotture del DNA introdotte dal sistema CRISPR/Cas9 vengono riparate attraverso vie endogene di giunzione non omologa (NHEJ), che spesso provocano mutazioni con spostamento del frame che annullano l'espressione della proteina CXXC5.
Questo sistema di knockout CRISPR consente la generazione efficiente di modelli cellulari carenti di CXXC5 per lo studio della segnalazione di CXXC5, studi di genomica funzionale, ricerca sulla biologia del cancro e valutazione delle risposte terapeutiche in linee cellulari umane.
Caratteristiche principali
- sgRNA mirati agli esoni CXXC5 critici per la funzione di CXXC5
Co-espressione di SpCas9 e sgRNA da un singolo plasmide per una somministrazione semplificata
Reporter GFP per l'identificazione delle cellule trasfettate
Pool di plasmidi mirati a più siti genomici di CXXC5 per migliorare l'efficienza del knockout
Compatibile con la somministrazione tramite trasfezione
Varianti di progettazione
CRISPR +/- HDR
- Gli gRNA codificati dal CXXC5 CRISPR/Cas9 KO Plasmid (h) e dal CXXC5 CRISPR/Cas9 KO Plasmid (h2) prendono di mira siti distinti all'interno del locus CXXC5. Potrebbe essere disponibile uno o entrambi i design di targeting. Vedere Prodotti correlati per la disponibilità.
I costrutti donatori HDR codificati dal CXXC5 Plasmide HDR (h) e il plasmide HDR CXXC5 (h2) contengono una cassetta di resistenza alla puromicina e un reporter RFP affiancato da bracci di omologia CXXC5 per supportare la riparazione diretta dall'omologia in siti bersaglio CXXC5 definiti corrispondenti ai disegni CRISPR/Cas9 KO. La disponibilità dei donatori HDR può variare. Vedere Prodotti correlati per la disponibilità.
Solo per uso di ricerca. Non destinato a uso diagnostico o terapeutico.