CTDSP1 Plasmide KO CRISPR/Cas9 (h): sc-406965

Panoramica

CTDSP1 (CTD small phosphatase 1) è una fosfatasi nucleare della famiglia delle haloacid dehalogenase (HAD) che defosforila il dominio C-terminale della RNA polimerasi II, contribuendo al controllo del ciclo trascrizionale e al coordinamento dei programmi di espressione genica. Modulando gli stati di fosforilazione che influenzano il superamento del promotore (promoter clearance) e l’elongazione trascrizionale, CTDSP1 contribuisce a plasmare il processamento dell’RNA e una più ampia omeostasi trascrizionale. CTDSP1 è stata inoltre associata alla regolazione di reti trascrizionali legate alla segnalazione e alla differenziazione, rendendola rilevante per studi sulle transizioni di stato cellulare e sulle risposte allo stress. Un’attività o un’espressione deregolate di CTDSP1 sono state investigate nel contesto di alterazioni della regolazione trascrizionale osservate in molteplici modelli di malattia, a supporto della sua utilità come bersaglio meccanicistico nella genomica funzionale.

Il plasmide CRISPR/Cas9 KO CTDSP1 (h) è un pool di plasmidi progettato per la distruzione mirata del gene CTDSP1 in linee cellulari human. Ciascun plasmide co-esprime un singolo RNA guida (sgRNA) unico che prende di mira un sito distinto all'interno del CTDSP1 insieme alla nucleasi Cas9 di Streptococcus pyogenes. I plasmidi codificano anche per la GFP, consentendo l'identificazione fluorescente e l'arricchimento delle cellule trasfettate con successo tramite microscopia a fluorescenza o citometria a flusso.

Il design multi-guida aumenta la probabilità di generare inserzioni o delezioni (indels) che interrompono il frame di lettura aperto CTDSP1 a seguito della formazione di rotture a doppio filamento mediate da Cas9. Le rotture del DNA introdotte dal sistema CRISPR/Cas9 vengono riparate attraverso vie endogene di giunzione non omologa (NHEJ), che spesso provocano mutazioni con spostamento del frame che annullano l'espressione della proteina CTDSP1.

Questo sistema di knockout CRISPR consente la generazione efficiente di modelli cellulari carenti di CTDSP1 per lo studio della segnalazione di CTDSP1, studi di genomica funzionale, ricerca sulla biologia del cancro e valutazione delle risposte terapeutiche in linee cellulari umane.

Caratteristiche principali

• sgRNA mirati agli esoni CTDSP1 critici per la funzione di CTDSP1
  Co-espressione di SpCas9 e sgRNA da un singolo plasmide per una somministrazione semplificata
  Reporter GFP per l'identificazione delle cellule trasfettate
  Pool di plasmidi mirati a più siti genomici di CTDSP1 per migliorare l'efficienza del knockout
  Compatibile con la somministrazione tramite trasfezione

Varianti di progettazione

CRISPR +/- HDR

• Gli gRNA codificati dal CTDSP1 CRISPR/Cas9 KO Plasmid (h) e dal CTDSP1 CRISPR/Cas9 KO Plasmid (h2) prendono di mira siti distinti all'interno del locus CTDSP1. Potrebbe essere disponibile uno o entrambi i design di targeting. Vedere Prodotti correlati per la disponibilità.
  I costrutti donatori HDR codificati dal CTDSP1 Plasmide HDR (h) e il plasmide HDR CTDSP1 (h2) contengono una cassetta di resistenza alla puromicina e un reporter RFP affiancato da bracci di omologia CTDSP1 per supportare la riparazione diretta dall'omologia in siti bersaglio CTDSP1 definiti corrispondenti ai disegni CRISPR/Cas9 KO. La disponibilità dei donatori HDR può variare. Vedere Prodotti correlati per la disponibilità.

Solo per uso di ricerca. Non destinato a uso diagnostico o terapeutico.