COL9A2 CRISPR/Cas9 KO Plasmid (h): sc-405890

Übersicht

COL9A2 kodiert die α2-Kette von Kollagen Typ IX, einem FACIT-Kollagen, das mit Kollagen‑Typ‑II‑Fibrillen assoziiert, um die extrazelluläre Matrix des hyalinen Knorpels zu stabilisieren und zu organisieren. Durch seinen Beitrag zur Fibrillogenese und zu Matrix‑Zell‑Interaktionen unterstützt COL9A2 die Funktion von Chondrozyten, die Zugfestigkeit des Knorpels sowie Mechanotransduktionsprozesse, die für die Skelettentwicklung und die Homöostase der Gelenke zentral sind. Störungen der COL9A2‑Expression oder ‑Struktur werden mit erblichen Knorpelerkrankungen in Verbindung gebracht und im Kontext früh einsetzender degenerativer Gelenkphänotypen sowie von Pathologien der Bandscheiben (intervertebralen Bandscheiben) untersucht. Als Matrixkomponente verknüpft COL9A2 den Umbau der extrazellulären Matrix mit Signalwegen, die die Knorpelintegrität steuern, darunter Kollagenassemblierung, Organisation von Proteoglykanen und stressresponsive Signalgebung in Chondrozyten.

Das COL9A2 CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (h) ist ein Pool von Plasmiden, die für die gezielte Disruption des COL9A2-Gens in human-Zelllinien entwickelt wurden. Jedes Plasmid koexprimiert eine einzigartige Single-Guide-RNA (sgRNA), die auf eine bestimmte Stelle innerhalb des COL9A2-Gens abzielt, zusammen mit der Streptococcus pyogenes Cas9-Nuklease. Die Plasmide kodieren zudem für GFP, was die fluoreszente Identifizierung und Anreicherung erfolgreich transfizierter Zellen mittels Fluoreszenzmikroskopie oder Durchflusszytometrie ermöglicht.

Das Multi-Guide-Design erhöht die Wahrscheinlichkeit, dass Insertionen oder Deletionen (Indels) entstehen, die den offenen Leserahmen von COL9A2 nach der Cas9-vermittelten Bildung von Doppelstrangbrüchen unterbrechen. Durch das CRISPR/Cas9-System verursachte DNA-Brüche werden über endogene NHEJ-Wege (Non-Homologous End Joining) repariert, was häufig zu Frameshift-Mutationen führt, die die COL9A2-Proteinexpression aufheben.

Dieses CRISPR-Knockout-System ermöglicht die effiziente Erzeugung von COL9A2-defizienten Zellmodellen zur Untersuchung der COL9A2-Signalübertragung, für funktionelle Genomstudien, in der Krebsbiologieforschung sowie zur Bewertung therapeutischer Reaktionen in menschlichen Zelllinien.

Hauptmerkmale

• sgRNAs, die auf COL9A2-Exone abzielen, die für die COL9A2-Funktion entscheidend sind
  Ko-Expression von SpCas9 und sgRNA aus einem einzigen Plasmid zur vereinfachten Verabreichung
  GFP-Reporter zur Identifizierung transfizierter Zellen
  Pool von Plasmiden, die auf mehrere COL9A2-Genomstellen abzielen, um die Knockout-Effizienz zu verbessern
  Kompatibel mit der Verabreichung durch Transfektion

Designvarianten

CRISPRs +/- HDRs

• gRNAs, die vom COL9A2 CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (h) und vom COL9A2 CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (h2) kodiert werden, zielen auf unterschiedliche Stellen innerhalb des COL9A2-Lokus ab. Es kann ein oder beide Targeting-Designs verfügbar sein. Siehe „Verwandte Produkte“ für Verfügbarkeit.
  HDR-Donorkonstrukte, kodiert durch das COL9A2 HDR-Plasmid (h) und COL9A2 HDR-Plasmid (h2) kodiert, enthalten eine Puromycin-Resistenzkassette und einen RFP-Reporter, flankiert von COL9A2-Homologiearmen, um die homologe Reparatur an definierten COL9A2-Zielstellen entsprechend den CRISPR/Cas9-KO-Designs zu unterstützen. Die Verfügbarkeit von HDR-Donoren kann variieren. Siehe „Verwandte Produkte“ für Verfügbarkeit.

Nur für Forschungszwecke. Nicht für diagnostische oder therapeutische Zwecke bestimmt.