COL11A2 CRISPR/Cas9 KO Plasmid (h): sc-406243

Übersicht

COL11A2 kodiert die α2‑Kette des Kollagens Typ XI, eines mengenmäßig untergeordneten, aber strukturell wichtigen fibrillären Kollagens, das sich mit Kollagen Typ II integriert, um den Durchmesser von Kollagenfibrillen und die Organisation der extrazellulären Matrix (EZM) zu regulieren, insbesondere im Knorpel. Seine Expression unterstützt die Differenzierung von Chondrozyten, die Gewebebiomechanik und den Matrixaufbau während der Skelettentwicklung und beeinflusst dabei Prozesse wie die Kollagenfibrillogenese und die Bildung der perizellulären Matrix. Störungen von COL11A2 wurden mit vererbbaren skelettalen Dysplasien und sensorineuralem Hörverlust in Verbindung gebracht, was seine Bedeutung für die Knorpelintegrität und die Architektur der extrazellulären Matrix im Innenohr widerspiegelt. Als Matrixgen wird COL11A2 außerdem genutzt, um EZM‑abhängige Signalwege und Zell‑Matrix‑Interaktionen zu untersuchen, die den zellulären Phänotyp modulieren.

Das COL11A2 CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (h) ist ein Pool von Plasmiden, die für die gezielte Disruption des COL11A2-Gens in human-Zelllinien entwickelt wurden. Jedes Plasmid koexprimiert eine einzigartige Single-Guide-RNA (sgRNA), die auf eine bestimmte Stelle innerhalb des COL11A2-Gens abzielt, zusammen mit der Streptococcus pyogenes Cas9-Nuklease. Die Plasmide kodieren zudem für GFP, was die fluoreszente Identifizierung und Anreicherung erfolgreich transfizierter Zellen mittels Fluoreszenzmikroskopie oder Durchflusszytometrie ermöglicht.

Das Multi-Guide-Design erhöht die Wahrscheinlichkeit, dass Insertionen oder Deletionen (Indels) entstehen, die den offenen Leserahmen von COL11A2 nach der Cas9-vermittelten Bildung von Doppelstrangbrüchen unterbrechen. Durch das CRISPR/Cas9-System verursachte DNA-Brüche werden über endogene NHEJ-Wege (Non-Homologous End Joining) repariert, was häufig zu Frameshift-Mutationen führt, die die COL11A2-Proteinexpression aufheben.

Dieses CRISPR-Knockout-System ermöglicht die effiziente Erzeugung von COL11A2-defizienten Zellmodellen zur Untersuchung der COL11A2-Signalübertragung, für funktionelle Genomstudien, in der Krebsbiologieforschung sowie zur Bewertung therapeutischer Reaktionen in menschlichen Zelllinien.

Hauptmerkmale

• sgRNAs, die auf COL11A2-Exone abzielen, die für die COL11A2-Funktion entscheidend sind
  Ko-Expression von SpCas9 und sgRNA aus einem einzigen Plasmid zur vereinfachten Verabreichung
  GFP-Reporter zur Identifizierung transfizierter Zellen
  Pool von Plasmiden, die auf mehrere COL11A2-Genomstellen abzielen, um die Knockout-Effizienz zu verbessern
  Kompatibel mit der Verabreichung durch Transfektion

Designvarianten

CRISPRs +/- HDRs

• gRNAs, die vom COL11A2 CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (h) und vom COL11A2 CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (h2) kodiert werden, zielen auf unterschiedliche Stellen innerhalb des COL11A2-Lokus ab. Es kann ein oder beide Targeting-Designs verfügbar sein. Siehe „Verwandte Produkte“ für Verfügbarkeit.
  HDR-Donorkonstrukte, kodiert durch das COL11A2 HDR-Plasmid (h) und COL11A2 HDR-Plasmid (h2) kodiert, enthalten eine Puromycin-Resistenzkassette und einen RFP-Reporter, flankiert von COL11A2-Homologiearmen, um die homologe Reparatur an definierten COL11A2-Zielstellen entsprechend den CRISPR/Cas9-KO-Designs zu unterstützen. Die Verfügbarkeit von HDR-Donoren kann variieren. Siehe „Verwandte Produkte“ für Verfügbarkeit.

Nur für Forschungszwecke. Nicht für diagnostische oder therapeutische Zwecke bestimmt.