BRD9 Plásmido CRISPR/Cas9 KO (m): sc-430581

Descripción general

El gen Brd9 de ratón codifica BRD9, un lector de cromatina con bromodominio que reconoce marcas de acetil-lisina en histonas y contribuye a la remodelación de la cromatina dependiente de ATP. BRD9 es un componente definitorio de los complejos BAF no canónicos (ncBAF/GBAF) y participa en la regulación de potenciadores y promotores, así como en programas transcripcionales que controlan la proliferación, la especificación de linaje y la identidad celular. A través de estas funciones epigenéticas, BRD9 influye en vías relacionadas con la respuesta al daño del ADN, el control del ciclo celular y las transiciones del estado de diferenciación. La desregulación de la remodelación de cromatina y de los circuitos transcripcionales asociados a BRD9 se ha implicado en contextos relevantes para la dependencia oncogénica y fenotipos del desarrollo, lo que lo convierte en un nodo útil para estudios mecanísticos en modelos de enfermedad.

El plásmido CRISPR/Cas9 KO BRD9 (m) es un conjunto de plásmidos diseñado para la interrupción dirigida del gen Brd9 en líneas celulares mouse. Cada plásmido coexpresa un ARN guía único (sgRNA) dirigido a un sitio distinto dentro del Brd9 junto con la nucleasa Cas9 de Streptococcus pyogenes. Los plásmidos también codifican GFP, lo que permite la identificación fluorescente y el enriquecimiento de las células transfectadas con éxito mediante microscopía de fluorescencia o citometría de flujo.

El diseño multiguía aumenta la probabilidad de generar inserciones o deleciones (indeles) que interrumpan el marco de lectura abierto de Brd9 tras la formación de roturas de doble cadena mediadas por Cas9. Las roturas de ADN introducidas por el sistema CRISPR/Cas9 se reparan a través de vías endógenas de unión de extremos no homólogos (NHEJ), lo que con frecuencia da lugar a mutaciones de desplazamiento del marco de lectura que anulan la expresión de la proteína BRD9.

Este sistema de knockout CRISPR permite la generación eficiente de modelos celulares deficientes en Brd9 para la investigación de la señalización de BRD9, estudios de genómica funcional, investigación en biología del cáncer y evaluación de respuestas terapéuticas en líneas celulares humanas.

Características principales

• sgRNA dirigidos a los exones de Brd9 críticos para la función de BRD9
  Coexpresión de SpCas9 y sgRNA a partir de un único plásmido para simplificar la administración
  Reportero GFP para la identificación de células transfectadas
  Conjunto de plásmidos dirigidos a múltiples sitios genómicos de Brd9 para mejorar la eficiencia del knockout
  Compatible con la administración mediante transfección

Variantes de diseño

CRISPRs +/- HDRs

• Los gRNA codificados por el plásmido BRD9 CRISPR/Cas9 KO (m) y el plásmido BRD9 CRISPR/Cas9 KO (m2) se dirigen a sitios distintos dentro del locus Brd9. Puede estar disponible uno o ambos diseños de orientación. Consulte «Productos relacionados» para conocer la disponibilidad.
  Las construcciones donantes HDR codificadas por el plásmido HDR BRD9 (m) y el plásmido HDR BRD9 (m2) contienen un casete de resistencia a la puromicina y un reportero RFP flanqueado por brazos de homología Brd9 para facilitar la reparación dirigida por homología en sitios diana Brd9 definidos que se corresponden con los diseños de KO de CRISPR/Cas9. La disponibilidad de los donantes HDR puede variar. Consulte «Productos relacionados» para conocer la disponibilidad.

Sólo para uso en investigación. No destinado a uso diagnóstico o terapéutico.