5-Isopropyl-2′-deoxyuridine (CAS 60136-25-6)

La 5-isopropil-2'-deossiuridina è un nucleoside modificato che presenta un gruppo isopropilico attaccato alla base uracile in posizione 5. Questa modifica strutturale altera significativamente le proprietà chimiche della molecola, rendendola uno strumento eccellente per lo studio della specificità e dell'attività degli enzimi coinvolti nella replicazione e nella riparazione del DNA. Questa modifica strutturale altera significativamente le proprietà chimiche della molecola, rendendola uno strumento eccellente per studiare la specificità e l'attività degli enzimi coinvolti nella replicazione e nella riparazione del DNA. La sua incorporazione in oligonucleotidi permette ai ricercatori di studiare l'influenza delle modifiche delle basi sulla fedeltà delle DNA polimerasi, esplorando come questi enzimi riconoscono e incorporano i nucleotidi modificati durante la sintesi del DNA. Ciò ha permesso di capire la natura a rischio di errore o a correzione di errore delle varie polimerasi e di decifrare l'architettura del loro sito attivo. Inoltre, la 5-isopropil-2'-deossiuridina serve come substrato per studiare la specificità di legame delle glicosilasi del DNA e di altre proteine di riparazione. È utile per chiarire i meccanismi delle vie di riparazione per escissione, rivelando come le basi danneggiate o modificate vengono riconosciute e rimosse per mantenere l'integrità del genoma. Inoltre, i ricercatori hanno utilizzato questo nucleoside modificato per esplorare le interazioni DNA-proteine incorporandolo in strutture modello di DNA, il che aiuta a comprendere le basi strutturali del riconoscimento proteico del DNA modificato. Nel complesso, questo composto offre una prospettiva unica nella chimica del DNA e contribuisce a far progredire la nostra comprensione di come le variazioni strutturali dei nucleosidi abbiano un impatto sulle risposte cellulari e sulla regolazione del materiale genetico.