Gli inibitori di Rpp30 sono progettati principalmente per la modulazione della sintesi, dell'elaborazione e della maturazione dell'RNA. Rpp30 svolge un ruolo centrale nella maturazione del tRNA e la sua funzione può essere modulata influenzando i processi e le vie più ampie del metabolismo dell'RNA. Sostanze chimiche come l'α-amanitina e l'actinomicina D bloccano la sintesi dell'RNA, influenzando così potenzialmente l'abbondanza e la dinamica dei substrati di RNA su cui agisce Rpp30.
D'altra parte, gli analoghi nucleosidici come la cordycepina e la toyocamicina imitano i nucleotidi nativi, ma hanno un effetto inibitorio. La loro inclusione durante la sintesi dell'RNA può interrompere il normale metabolismo dell'RNA, modulando indirettamente i processi in cui è coinvolto Rpp30. Allo stesso modo, i composti che agiscono sullo splicing, come la spliceostatina A e il pladienolide B, possono modellare il paesaggio dell'elaborazione dell'RNA e influenzare indirettamente le operazioni a cui partecipa Rpp30.
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