Gli attivatori POMZP3 comprendono una classe di agenti chimici specificamente progettati per legarsi alla proteina POMZP3 e aumentarne l'attività. POMZP3, abbreviazione di POM121 e ZP3 fusion, è una proteina relativamente oscura la cui funzione e importanza nella biologia cellulare non sono ampiamente documentate nella letteratura scientifica. Tuttavia, come altre proteine, la sua attività è presumibilmente legata a determinati processi cellulari o vie di segnalazione. Sviluppando molecole in grado di regolare l'attività di POMZP3, i ricercatori intendono comprendere meglio il suo ruolo all'interno della cellula. La scoperta di tali attivatori comporta in genere un processo in più fasi, che comprende l'analisi bioinformatica per prevedere la struttura della proteina, uno screening ad alto rendimento per identificare potenziali composti attivatori e saggi biochimici meticolosi per determinare l'efficacia e la specificità di questi attivatori nei confronti della proteina POMZP3. Dato che POMZP3 non è un bersaglio ben caratterizzato, questi attivatori sarebbero preziosi anche per chiarire le funzioni biologiche della proteina.
La creazione di attivatori di POMZP3 è una sfida che richiede un approccio interdisciplinare, che combina chimica computazionale, biologia molecolare e chimica sintetica. Gli sforzi iniziali si concentreranno probabilmente sulla generazione di un modello 3D di POMZP3, utilizzando le previsioni computazionali basate sulle strutture proteiche note per ipotizzare i siti attivi o di legame della proteina. Con questi modelli, i chimici possono progettare e sintetizzare molecole che si prevede interagiscano con questi siti. Dopo la sintesi di queste molecole, esse vengono testate in vari saggi in vitro per misurare la loro capacità di legarsi e attivare POMZP3. Questi saggi possono includere, ma non sono limitati a, il trasferimento di energia di risonanza di fluorescenza (FRET), la risonanza plasmonica di superficie (SPR) o la calorimetria isotermica di titolazione (ITC), che possono misurare quantitativamente l'affinità di legame e le proprietà cinetiche delle interazioni. Dopo l'identificazione dei composti guida, viene condotto uno studio SAR dettagliato per ottimizzare l'interazione tra gli attivatori e POMZP3. Ciò comporta la modifica sistematica della struttura chimica dei composti guida e la correlazione di questi cambiamenti con l'aumento o la diminuzione dell'attività di POMZP3. Attraverso questi passaggi meticolosi, le molecole vengono perfezionate per produrre attivatori di POMZP3 potenti e selettivi. Questi attivatori possono essere utilizzati come sonde molecolari per studiare l'attività biologica di POMZP3 in un ambiente controllato, fornendo preziose informazioni sul ruolo e la funzione della proteina all'interno della cellula.
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Nome del prodotto | CAS # | Codice del prodotto | Quantità | Prezzo | CITAZIONI | Valutazione |
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Trichostatin A | 58880-19-6 | sc-3511 sc-3511A sc-3511B sc-3511C sc-3511D | 1 mg 5 mg 10 mg 25 mg 50 mg | $149.00 $470.00 $620.00 $1199.00 $2090.00 | 33 | |
La tricostatina A è un inibitore dell'istone deacetilasi che può alterare la struttura della cromatina e potenzialmente aumentare l'espressione di geni ingegnerizzati. | ||||||
Forskolin | 66575-29-9 | sc-3562 sc-3562A sc-3562B sc-3562C sc-3562D | 5 mg 50 mg 1 g 2 g 5 g | $76.00 $150.00 $725.00 $1385.00 $2050.00 | 73 | |
La forskolina aumenta i livelli di cAMP, che può portare all'attivazione della proteina chinasi A e potenzialmente aumentare la trascrizione di alcuni geni. | ||||||
PMA | 16561-29-8 | sc-3576 sc-3576A sc-3576B sc-3576C sc-3576D | 1 mg 5 mg 10 mg 25 mg 100 mg | $40.00 $129.00 $210.00 $490.00 $929.00 | 119 | |
Il PMA attiva la proteina chinasi C che può portare a cambiamenti nell'espressione genica, potenzialmente influenzando un promotore ingegnerizzato che guida la proteina di fusione. | ||||||
Retinoic Acid, all trans | 302-79-4 | sc-200898 sc-200898A sc-200898B sc-200898C | 500 mg 5 g 10 g 100 g | $65.00 $319.00 $575.00 $998.00 | 28 | |
L'acido retinoico regola l'espressione genica attraverso i suoi recettori nucleari e può influenzare l'espressione di costrutti geneticamente modificati. | ||||||
Sodium Butyrate | 156-54-7 | sc-202341 sc-202341B sc-202341A sc-202341C | 250 mg 5 g 25 g 500 g | $30.00 $46.00 $82.00 $218.00 | 18 | |
Il butirrato di sodio è un inibitore dell'istone deacetilasi che può causare l'iperacetilazione degli istoni, aumentando potenzialmente l'espressione genica. | ||||||
(−)-Epigallocatechin Gallate | 989-51-5 | sc-200802 sc-200802A sc-200802B sc-200802C sc-200802D sc-200802E | 10 mg 50 mg 100 mg 500 mg 1 g 10 g | $42.00 $72.00 $124.00 $238.00 $520.00 $1234.00 | 11 | |
L'EGCG ha vari effetti cellulari, tra cui la modulazione di marcatori epigenetici e potrebbe influenzare l'espressione di geni ingegnerizzati. | ||||||
Rapamycin | 53123-88-9 | sc-3504 sc-3504A sc-3504B | 1 mg 5 mg 25 mg | $62.00 $155.00 $320.00 | 233 | |
La rapamicina inibisce mTOR, che è coinvolto nella regolazione della crescita cellulare e può avere effetti a valle sull'espressione genica. | ||||||
Lithium | 7439-93-2 | sc-252954 | 50 g | $214.00 | ||
Il litio può influenzare la segnalazione Wnt ed è stato osservato che influisce sull'espressione genica, che potrebbe includere una fusione POM121/ZP3 ingegnerizzata. | ||||||
β-Estradiol | 50-28-2 | sc-204431 sc-204431A | 500 mg 5 g | $62.00 $178.00 | 8 | |
Il beta-estradiolo può agire come regolatore trascrizionale per alcuni geni, influenzando potenzialmente quelli introdotti artificialmente nelle cellule. | ||||||
Dexamethasone | 50-02-2 | sc-29059 sc-29059B sc-29059A | 100 mg 1 g 5 g | $76.00 $82.00 $367.00 | 36 | |
Il desametasone agisce come agonista del recettore dei glucocorticoidi e può modulare l'espressione di vari geni, compresi potenzialmente i costrutti ingegnerizzati. |