Pol II-H Inibitori

I comuni inibitori della Pol II-H includono, ma non solo, l'α-Amanitina CAS 23109-05-9, il DRB CAS 53-85-0, il Triptolide CAS 38748-32-2, il Flavopiridolo CAS 146426-40-6 e la Cordycepina CAS 73-03-0.

Gli inibitori chimici della RNA polimerasi II (Pol II-H) comprendono una vasta gamma di composti che mirano a vari aspetti della funzione dell'enzima durante il processo di trascrizione. L'α-Amanitina è uno di questi inibitori che esercita i suoi effetti legandosi all'elica ponte dell'RNA polimerasi II, un componente cruciale coinvolto nel ciclo di addizione dei nucleotidi. Questo legame ostacola la traslocazione dell'RNA polimerasi II lungo il templato del DNA, impedendo così la fase di allungamento della trascrizione. Allo stesso modo, DRB compromette la funzione della Pol II-H, mirando al dominio C-terminale (CTD), precludendo gli eventi di fosforilazione necessari per l'avvio e l'allungamento della trascrizione. Il triptolide adotta un approccio diverso, legandosi covalentemente alla subunità XPB del complesso di fattori di trascrizione TFIIH, inibendo l'attività ATPasica e di conseguenza l'avvio della trascrizione. Il flavopiridolo agisce inibendo le chinasi ciclina-dipendenti (CDK), che sono parte integrante della fosforilazione della CTD della Pol II, una modifica essenziale per la progressione della trascrizione.

Altri composti che interrompono la funzione di Pol II-H includono la cordycepina, che si integra nel filamento di RNA nascente e induce una terminazione prematura imitando un nucleotide ma mancando dei gruppi idrossilici necessari per l'allungamento della catena. L'ICRF-193 ostacola l'attività della topoisomerasi II, un enzima che modula il superavvolgimento del DNA, un requisito per Pol II-H per trascrivere efficacemente il DNA. L'actinomicina D, invece, si intercala nel DNA e ostacola la progressione della Pol II-H bloccando fisicamente il movimento del complesso di trascrizione lungo il filamento di DNA. Il BAY 11-7082 abroga l'attivazione di NF-κB, un fattore di trascrizione che regola i geni elaborati da Pol II-H, influenzando così indirettamente la funzione di Pol II-H. La cantaridina impedisce l'attività della Pol II-H inibendo le fosfatasi proteiche 1 e 2A, alterando lo stato di fosforilazione della CTD. La meayamicina è un inibitore della Pol II-H; si lega al complesso di trascrizione, impedendo il rilascio del trascritto di RNA durante l'allungamento. Ciascuna di queste sostanze chimiche utilizza un meccanismo distinto per inibire l'attività trascrizionale di Pol II-H.