Gli attivatori LOC400958 rappresenterebbero una categoria di composti chimici ingegnerizzati per modulare l'attività di una proteina codificata dal locus genetico denominato LOC400958. Nel campo della nomenclatura genetica, LOC è un prefisso utilizzato per indicare un locus che è stato identificato attraverso il sequenziamento genomico e gli sforzi di annotazione, ma che potrebbe non essere completamente caratterizzato in termini di funzione biologica o di prodotto. Il numero che accompagna il LOC, in questo caso 400958, serve come identificatore unico che permette agli scienziati di individuare la posizione esatta di questo gene all'interno della vasta estensione del genoma umano. I composti classificati come attivatori interagiscono specificamente con il prodotto genico di LOC400958, aumentandone potenzialmente l'attività naturale all'interno della cellula. Il meccanismo preciso con cui questi attivatori funzionano potrebbe variare, ma tutti avrebbero l'obiettivo comune di promuovere l'attività della proteina LOC400958.
La scoperta e l'ottimizzazione degli attivatori di LOC400958 sarebbe un processo complesso, che inizia con lo studio dettagliato della proteina LOC400958 stessa. Supponendo che il prodotto di questo locus sia una proteina, sarebbe fondamentale comprenderne la struttura, la dinamica e i partner di interazione all'interno della cellula. Ciò potrebbe comportare tecniche biochimiche avanzate per esprimere e purificare la proteina, seguite da approcci di biologia strutturale come la cristallografia a raggi X, la spettroscopia NMR o la microscopia crioelettronica per determinarne la struttura tridimensionale. La conoscenza della struttura della proteina sarebbe particolarmente preziosa, in quanto potrebbe rivelare potenziali siti di legame per piccole molecole che potrebbero agire come attivatori. Questi siti potrebbero essere allosterici, consentendo di regolare l'attività della proteina senza interferire direttamente con il sito attivo dove si legano i substrati naturali. Una volta identificati i potenziali bersagli, il passo successivo sarà quello di progettare, sintetizzare e analizzare una libreria di composti chimici per verificarne la capacità di legarsi alla proteina LOC400958 e di attivarla. Le tecniche di screening ad alto rendimento consentirebbero di valutare rapidamente molti composti, identificando quelli con un'attività promettente. Questi risultati iniziali verrebbero poi sottoposti a un processo di affinamento della chimica medicinale, in cui le loro strutture chimiche verrebbero metodicamente modificate per migliorarne la potenza, la selettività e la capacità complessiva di attivare la proteina LOC400958. Questo processo iterativo di progettazione, sintesi e valutazione biologica continuerebbe fino a ottenere un insieme di composti con caratteristiche ottimali come attivatori di LOC400958, in grado di modulare efficacemente l'attività del prodotto genico LOC400958.
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Nome del prodotto | CAS # | Codice del prodotto | Quantità | Prezzo | CITAZIONI | Valutazione |
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5-Aza-2′-Deoxycytidine | 2353-33-5 | sc-202424 sc-202424A sc-202424B | 25 mg 100 mg 250 mg | $214.00 $316.00 $418.00 | 7 | |
Un inibitore della DNA metiltransferasi che può demetilare il DNA e potenzialmente portare all'attivazione dell'espressione di lncRNA, tra cui LINC02245. | ||||||
Retinoic Acid, all trans | 302-79-4 | sc-200898 sc-200898A sc-200898B sc-200898C | 500 mg 5 g 10 g 100 g | $65.00 $319.00 $575.00 $998.00 | 28 | |
Coinvolto nella regolazione genica e nella differenziazione, può modulare l'espressione di numerosi geni, tra cui potenzialmente lncRNA come LINC02245. | ||||||
Trichostatin A | 58880-19-6 | sc-3511 sc-3511A sc-3511B sc-3511C sc-3511D | 1 mg 5 mg 10 mg 25 mg 50 mg | $149.00 $470.00 $620.00 $1199.00 $2090.00 | 33 | |
Un inibitore dell'istone deacetilasi che può modificare la struttura della cromatina e influenzare l'espressione di un'ampia gamma di geni, compresi gli lncRNA. | ||||||
β-Estradiol | 50-28-2 | sc-204431 sc-204431A | 500 mg 5 g | $62.00 $178.00 | 8 | |
Ormone steroideo in grado di regolare l'espressione genica attraverso i recettori degli estrogeni; può influenzare l'espressione di lncRNA come parte delle sue azioni genomiche. | ||||||
Cholecalciferol | 67-97-0 | sc-205630 sc-205630A sc-205630B | 1 g 5 g 10 g | $70.00 $160.00 $290.00 | 2 | |
Attraverso il suo metabolita attivo, può legarsi ai recettori della vitamina D e modulare l'espressione genica, che può includere gli lncRNA. | ||||||
Sodium Butyrate | 156-54-7 | sc-202341 sc-202341B sc-202341A sc-202341C | 250 mg 5 g 25 g 500 g | $30.00 $46.00 $82.00 $218.00 | 18 | |
Come inibitore dell'istone deacetilasi, può causare cambiamenti epigenetici e potenzialmente influenzare la trascrizione di lncRNA. | ||||||
Mithramycin A | 18378-89-7 | sc-200909 | 1 mg | $54.00 | 6 | |
Un antibiotico antitumorale che può legarsi al DNA e influenzare la trascrizione, alterando potenzialmente l'espressione degli lncRNA. | ||||||
Genistein | 446-72-0 | sc-3515 sc-3515A sc-3515B sc-3515C sc-3515D sc-3515E sc-3515F | 100 mg 500 mg 1 g 5 g 10 g 25 g 100 g | $26.00 $92.00 $120.00 $310.00 $500.00 $908.00 $1821.00 | 46 | |
Un fitoestrogeno che può modulare l'espressione genica attraverso meccanismi epigenetici e potenzialmente influenzare la trascrizione di lncRNA. | ||||||
Actinomycin D | 50-76-0 | sc-200906 sc-200906A sc-200906B sc-200906C sc-200906D | 5 mg 25 mg 100 mg 1 g 10 g | $73.00 $238.00 $717.00 $2522.00 $21420.00 | 53 | |
È noto per intercalare il DNA e inibire la trascrizione, il che potrebbe influenzare in modo non specifico l'espressione di lncRNA, tra cui LINC02245. | ||||||
Hydroxyurea | 127-07-1 | sc-29061 sc-29061A | 5 g 25 g | $76.00 $255.00 | 18 | |
Un inibitore della ribonucleotide reduttasi che può perturbare la sintesi del DNA e potenzialmente influenzare l'espressione degli lncRNA. |