L'attività funzionale di FAM12B può essere inibita indirettamente attraverso l'interruzione di varie vie di segnalazione che sono cruciali per la sua regolazione e attività. Gli inibitori delle chinasi, come quelli che hanno come bersaglio diverse protein-chinasi, possono ostacolare i processi di fosforilazione, che sono fondamentali per l'attività funzionale di numerose proteine. Quando queste cascate di fosforilazione vengono interrotte, le proteine che richiedono la fosforilazione per la loro attività, come FAM12B, subiscono una diminuzione della loro capacità funzionale. Analogamente, gli inibitori della via di segnalazione PI3K/Akt, impedendo l'attivazione dei bersagli a valle, portano a una riduzione della fosforilazione e, di conseguenza, dell'attività delle proteine associate a questa via. Questo approccio indiretto all'inibizione si estende al blocco della segnalazione di mTORC1, che può ridurre la sintesi proteica e influenzare le proteine regolate da o a valle di questa via.
Altri meccanismi di inibizione indiretta includono l'interferenza con la via MAPK/ERK mediante inibitori specifici di MEK, che possono ostacolare la fosforilazione e la successiva funzione delle proteine modulate dalla segnalazione ERK, con un potenziale impatto su FAM12B. Anche gli inibitori della p38 MAP chinasi e della JNK contribuiscono a questo approccio multiforme influenzando le risposte cellulari allo stress e ai segnali infiammatori, riducendo potenzialmente l'attività delle proteine legate a queste risposte. Inoltre, gli inibitori del proteasoma causano l'accumulo di proteine poliubiquitinate, che possono influenzare la stabilità e la funzione di una serie di proteine, tra cui FAM12B. Anche gli inibitori delle chinasi ciclino-dipendenti e gli inibitori della pompa SERCA svolgono un ruolo, interrompendo rispettivamente la segnalazione legata al ciclo cellulare e l'omeostasi del calcio. Queste interruzioni possono portare indirettamente all'inibizione di proteine regolate da meccanismi come la fosforilazione dipendente dal ciclo cellulare o da processi dipendenti dal calcio.
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