EF-1 ε1 Inibitori

I comuni inibitori dell'EF-1 ε1 includono, ma non solo, la cicloeximide CAS 66-81-9, l'anisomicina CAS 22862-76-6, l'emetina CAS 483-18-1, il cloridrato di puromicina CAS 58-58-2 e la tetraciclina CAS 60-54-8.

Gli inibitori chimici di EF-1 ε1 possono funzionare attraverso vari meccanismi, principalmente interrompendo il processo di sintesi proteica in diverse fasi. La cicloeximide è un noto inibitore che ha come bersaglio la fase di traslocazione della sintesi proteica nelle cellule eucariotiche, colpendo direttamente la fase di allungamento in cui EF-1 ε1 è attivo. Impedendo l'allungamento delle catene polipeptidiche, la cicloeximide inibisce efficacemente la funzione di EF-1 ε1. Analogamente, l'anisomicina interrompe la sintesi proteica inibendo l'attività della peptidiltrasferasi nei ribosomi, essenziale per l'allungamento delle catene peptidiche, inibendo così indirettamente l'attività di EF-1 ε1. La ricina, una potente proteina inattivante dei ribosomi, depurina uno specifico residuo di adenina nell'RNA ribosomiale, criticamente importante per il legame dei fattori di allungamento, e questa azione impedisce a EF-1 ε1 di svolgere il suo ruolo nell'allungamento della traduzione.

Inoltre, l'emetina e la puromicina agiscono come inibitori legandosi rispettivamente alle subunità ribosomiali e mimando l'aminoacil-tRNA. Il legame dell'emetina con la subunità 40S ostacola il movimento ribosomiale lungo l'mRNA, mentre la puromicina induce la terminazione prematura della catena, determinando entrambi l'inibizione funzionale di EF-1 ε1. La tetraciclina e il cloramfenicolo, pur avendo come bersaglio principale i ribosomi batterici, influirebbero, con un meccanismo simile, sulle cellule eucariotiche impedendo all'aminoacil-tRNA di legarsi al sito A del ribosoma e inibendo, rispettivamente, l'attività della peptidiltrasferasi. Ciò comporterebbe un'inibizione indiretta della funzione di EF-1 ε1 nell'allungamento delle proteine. Anche l'acido fusidico, che inibisce il turnover del fattore di allungamento G nei batteri, per un meccanismo simile, interromperebbe il processo complessivo di sintesi proteica, influenzando la funzione di EF-1 ε1. Inoltre, l'arringtonina impedisce la fase iniziale di allungamento della traduzione, inibendo così direttamente la funzione di EF-1 ε1. L'α-Sarcin ottiene l'inibizione attraverso la scissione di un legame specifico nell'RNA ribosomiale, inibendo il legame dei fattori di allungamento al ribosoma, tra cui EF-1 ε1. La sparsomicina e la licorina interferiscono entrambe con la capacità del ribosoma di formare legami peptidici e di procedere con la fase di allungamento. La sparsomicina si lega direttamente alla cavità della peptidiltrasferasi, mentre la licorina interrompe sia la fase di iniziazione che quella di allungamento della sintesi proteica.