Gli attivatori di DDX31, come già detto, svolgono un ruolo nel metabolismo dell'RNA, nell'energia cellulare e nel paesaggio trascrizionale. Ad esempio, l'acido betulinico, aumentando i livelli di ATP, può aumentare il potenziale di srotolamento dell'RNA di DDX31, data la dipendenza dell'elicasi DEAD-box dall'ATP. Composti come il db-cAMP e la forskolina portano a un aumento del cAMP cellulare, innescando potenzialmente processi dipendenti dalle elicasi. Analogamente, gli effetti dell'AICAR sull'attività dell'AMPK o l'influenza diretta del D-ribosio sulla sintesi dell'RNA sottolineano probabilmente la necessità di elicasi dell'RNA.
Agenti che danneggiano il DNA come l'etoposide possono aumentare indirettamente la necessità di meccanismi di riparazione dell'RNA, coinvolgendo DDX31. L'alterazione dell'ambiente trascrizionale con agenti come il sulforafano, il BAY 11-7082, la daidzeina e il dimetil fumarato potrebbe richiedere un'accresciuta attività dell'RNA elicasi per mantenere la fedeltà dell'RNA a fronte di un'espressione genica alterata. Questi composti sono esempi notevoli di come i modulatori indiretti possano influenzare le funzioni di proteine come DDX31, sottolineando la natura intrecciata dei percorsi e dei macchinari cellulari.
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