La classificazione nota come attivatori di 5830415L20Rik comprende una serie di sostanze chimiche in grado di promuovere l'espressione del gene 5830415L20Rik. Il viaggio alla scoperta di questi attivatori inizia in genere con lo screening ad alta velocità (HTS), un metodo che consente di valutare simultaneamente una vasta libreria di composti chimici per verificarne l'effetto sull'espressione genica. Questo processo si basa sull'uso di un saggio del gene reporter, un sistema in cui un gene reporter facilmente misurabile è fuso alla regione regolatoria del gene 5830415L20Rik. Quando le cellule dotate di questo costrutto reporter sono esposte a una miriade di entità chimiche, i composti in grado di attivare il promotore provocheranno un aumento del segnale del gene reporter. Questo segnale può manifestarsi come fluorescenza, luminescenza o altro marcatore quantificabile, che riflette l'efficienza del composto nell'attivare il gene. I composti che producono un aumento considerevole del segnale del reporter vengono selezionati per un ulteriore esame, in quanto ciò suggerisce che sono in grado di guidare l'attività del promotore 5830415L20Rik.
Nella successiva fase di validazione, i composti che hanno mostrato un'attività promettente nell'HTS vengono rigorosamente testati per confermare la loro funzione di veri attivatori del gene 5830415L20Rik. La prima fase di questo processo di validazione prevede spesso la PCR quantitativa (qPCR), che misura l'abbondanza di mRNA di 5830415L20Rik nelle cellule dopo l'interazione con i composti. Un aumento dei livelli di mRNA, come rilevato dalla qPCR, convalida che il composto può avviare l'attività trascrizionale del gene. Per assicurarsi che l'aumento dell'mRNA non sia un evento isolato, ma porti alla sintesi di proteine, viene condotta un'analisi Western blot. Questa tecnica prevede la separazione delle proteine dai lisati cellulari mediante elettroforesi su gel, seguita dal loro trasferimento su una membrana che viene poi testata con anticorpi specifici per la proteina 5830415L20Rik. L'aumento dell'intensità del segnale delle bande proteiche sul Western blot, rispetto ai campioni di controllo, conferma che i composti attivatori possono facilitare non solo la trascrizione ma anche la traduzione del gene. Questi due potenti metodi analitici -qPCR e Western blot- forniscono complessivamente un quadro solido per verificare l'influenza dei composti chimici sull'espressione del gene 5830415L20Rik, assicurando che gli attivatori possono modulare efficacemente l'espressione genica sia a livello di trascritto che di proteina.
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| Nome del prodotto | CAS # | Codice del prodotto | Quantità | Prezzo | CITAZIONI | Valutazione |
|---|---|---|---|---|---|---|
PMA | 16561-29-8 | sc-3576 sc-3576A sc-3576B sc-3576C sc-3576D | 1 mg 5 mg 10 mg 25 mg 100 mg | $40.00 $129.00 $210.00 $490.00 $929.00 | 119 | |
Il PMA è un potente attivatore della protein chinasi C (PKC). L'attivazione della PKC può portare alla fosforilazione di proteine che fanno parte della stessa via di segnalazione della 5830415L20Rik, potenzialmente migliorando l'attività funzionale della proteina alterando il suo stato di fosforilazione o l'attività delle proteine associate. | ||||||
Ionomycin | 56092-82-1 | sc-3592 sc-3592A | 1 mg 5 mg | $76.00 $265.00 | 80 | |
La ionomicina è uno ionoforo di calcio che aumenta i livelli di calcio intracellulare, che può attivare le proteine e le vie di segnalazione calcio-dipendenti. Questo aumento del calcio può influenzare i percorsi che interagiscono o influenzano il 5830415L20Rik, portando ad una sua maggiore attività. | ||||||
(−)-Epigallocatechin Gallate | 989-51-5 | sc-200802 sc-200802A sc-200802B sc-200802C sc-200802D sc-200802E | 10 mg 50 mg 100 mg 500 mg 1 g 10 g | $42.00 $72.00 $124.00 $238.00 $520.00 $1234.00 | 11 | |
L'EGCG è un noto inibitore di varie chinasi, potenzialmente in grado di alterare i percorsi di segnalazione che convergono o regolano 5830415L20Rik. Inibendo le chinasi regolatrici competitive o negative, l'EGCG potrebbe migliorare indirettamente l'attività funzionale di 5830415L20Rik. | ||||||
LY 294002 | 154447-36-6 | sc-201426 sc-201426A | 5 mg 25 mg | $121.00 $392.00 | 148 | |
LY294002 è un inibitore del percorso della fosfatidilinositolo 3-chinasi (PI3K). Inibendo la PI3K, LY294002 può alterare la segnalazione a valle che potrebbe includere chinasi o altre molecole che regolano 5830415L20Rik, portando alla sua attivazione indiretta. | ||||||
Dibutyryl-cAMP | 16980-89-5 | sc-201567 sc-201567A sc-201567B sc-201567C | 20 mg 100 mg 500 mg 10 g | $45.00 $130.00 $480.00 $4450.00 | 74 | |
Il db-cAMP è un analogo del cAMP permeabile alle cellule che attiva la PKA. La PKA può modulare varie proteine e vie di segnalazione che potrebbero essere coinvolte nella regolazione di 5830415L20Rik, con possibile risultato di una maggiore attività della proteina. | ||||||
Rolipram | 61413-54-5 | sc-3563 sc-3563A | 5 mg 50 mg | $75.00 $212.00 | 18 | |
Il Rolipram è un inibitore selettivo della PDE4, che porta ad un aumento dei livelli di cAMP all'interno della cellula. Il cAMP elevato può attivare la PKA, che può poi fosforilare i substrati o influenzare i percorsi di segnalazione che includono il 5830415L20Rik, portando alla sua attività potenziata. | ||||||
Anisomycin | 22862-76-6 | sc-3524 sc-3524A | 5 mg 50 mg | $97.00 $254.00 | 36 | |
L'anisomicina è un attivatore JNK che può modulare l'attività di varie proteine attraverso la fosforilazione. L'attivazione di JNK potrebbe potenzialmente potenziare l'attività del 5830415L20Rik in modo indiretto, modulando le proteine che interagiscono con esso o che lo regolano all'interno della sua via di segnalazione. | ||||||
Zaprinast (M&B 22948) | 37762-06-4 | sc-201206 sc-201206A | 25 mg 100 mg | $103.00 $245.00 | 8 | |
Zaprinast è un inibitore di PDE5 e PDE6, con conseguente aumento dei livelli di cGMP. Il cGMP elevato può attivare la PKG, potenzialmente potenziando i percorsi di segnalazione che coinvolgono 5830415L20Rik, portando alla sua attivazione indiretta. | ||||||