Nel contesto degli attivatori del 2500003M10Rik, la metodologia HTS è incentrata su un sistema di saggio reporter sensibile all'attività trascrizionale del gene 2500003M10Rik. In genere, un gene reporter, che potrebbe produrre un segnale fluorescente o luminescente, viene posizionato sotto le sequenze regolatorie del gene 2500003M10Rik. Quando un composto della libreria selezionata attiva il promotore, innesca l'espressione del gene reporter, producendo un segnale rilevabile. La forza di questo segnale è correlata all'attività del promotore e, per estensione, al potenziale del composto come attivatore. Una volta isolati i potenziali attivatori del gene 2500003M10Rik attraverso l'HTS, essi vengono sottoposti a una serie di saggi di validazione per confermarne l'attività. Uno dei principali metodi di validazione è la reazione a catena della polimerasi quantitativa (qPCR), che fornisce una quantificazione precisa dei livelli di mRNA del gene 2500003M10Rik dopo l'interazione con i composti.
Un aumento osservato delle quantità di mRNA rispetto ai controlli non trattati indicherebbe che il composto può aumentare l'espressione genica a livello trascrizionale. Inoltre, per verificare che questo aumento di mRNA si traduca in produzione di proteine, viene eseguita l'analisi Western blot. Questa tecnica consente di visualizzare e quantificare la proteina specifica che il gene 2500003M10Rik codifica. La presenza di livelli proteici più elevati nelle cellule con il composto convaliderebbe la funzione del composto come attivatore. Integrando i dati della qPCR e del Western blot, i ricercatori possono confermare che il composto non si limita ad aumentare i livelli di mRNA, ma garantisce anche un incremento della sintesi della proteina corrispondente. Questi rigorosi metodi analitici sono fondamentali per una valutazione completa dell'effetto del composto sulla via di espressione genica, dalla trascrizione alla sintesi proteica, stabilendo così un chiaro profilo delle proprietà attivanti del composto sul gene 2500003M10Rik.
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| Nome del prodotto | CAS # | Codice del prodotto | Quantità | Prezzo | CITAZIONI | Valutazione |
|---|---|---|---|---|---|---|
(−)-Epigallocatechin Gallate | 989-51-5 | sc-200802 sc-200802A sc-200802B sc-200802C sc-200802D sc-200802E | 10 mg 50 mg 100 mg 500 mg 1 g 10 g | $42.00 $72.00 $124.00 $238.00 $520.00 $1234.00 | 11 | |
L'EGCG agisce come un inibitore di chinasi, riducendo potenzialmente la fosforilazione competitiva e quindi potrebbe potenziare selettivamente l'attività delle chinasi che fosforilano 2500003M10Rik, portando ad un aumento della sua attività. | ||||||
LY 294002 | 154447-36-6 | sc-201426 sc-201426A | 5 mg 25 mg | $121.00 $392.00 | 148 | |
LY294002 è un inibitore di PI3K. Inibendo PI3K, potrebbe alterare le vie di segnalazione a valle, come AKT, portando potenzialmente a un meccanismo di compensazione che aumenta l'attività di 2500003M10Rik. | ||||||
Wortmannin | 19545-26-7 | sc-3505 sc-3505A sc-3505B | 1 mg 5 mg 20 mg | $66.00 $219.00 $417.00 | 97 | |
La wortmannina, un altro inibitore di PI3K, potrebbe influenzare in modo simile la via PI3K/AKT, portando a cambiamenti che potenziano l'attività di 2500003M10Rik attraverso una modulazione indiretta delle reti di segnalazione. | ||||||
SB 203580 | 152121-47-6 | sc-3533 sc-3533A | 1 mg 5 mg | $88.00 $342.00 | 284 | |
SB203580 è un inibitore di p38 MAPK. Inibendo la p38, potrebbe spostare l'equilibrio della segnalazione cellulare in modo da potenziare i percorsi in cui è coinvolto 2500003M10Rik, portando ad un aumento dell'attività della proteina. | ||||||
A23187 | 52665-69-7 | sc-3591 sc-3591B sc-3591A sc-3591C | 1 mg 5 mg 10 mg 25 mg | $54.00 $128.00 $199.00 $311.00 | 23 | |
A23187 agisce come ionoforo per il calcio. L'aumento del calcio intracellulare può attivare vie di segnalazione calcio-dipendenti, che a loro volta potrebbero potenziare l'attività di 2500003M10Rik. | ||||||
Staurosporine | 62996-74-1 | sc-3510 sc-3510A sc-3510B | 100 µg 1 mg 5 mg | $82.00 $150.00 $388.00 | 113 | |
Come inibitore di chinasi ad ampio spettro, la staurosporina potrebbe inibire le chinasi che regolano negativamente il 2500003M10Rik, aumentandone così indirettamente l'attività. | ||||||
D-erythro-Sphingosine-1-phosphate | 26993-30-6 | sc-201383 sc-201383D sc-201383A sc-201383B sc-201383C | 1 mg 2 mg 5 mg 10 mg 25 mg | $162.00 $316.00 $559.00 $889.00 $1693.00 | 7 | |
La sfingosina-1-fosfato funziona attraverso recettori accoppiati a proteine G, influenzando potenzialmente le vie di segnalazione che potenziano l'attività di 2500003M10Rik. | ||||||
Thapsigargin | 67526-95-8 | sc-24017 sc-24017A | 1 mg 5 mg | $94.00 $349.00 | 114 | |
La tapigargina altera l'omeostasi del calcio inibendo la pompa SERCA, che potrebbe elevare il calcio citosolico e attivare vie di segnalazione che potenziano l'attività di 2500003M10Rik. | ||||||
Genistein | 446-72-0 | sc-3515 sc-3515A sc-3515B sc-3515C sc-3515D sc-3515E sc-3515F | 100 mg 500 mg 1 g 5 g 10 g 25 g 100 g | $26.00 $92.00 $120.00 $310.00 $500.00 $908.00 $1821.00 | 46 | |
La genisteina è un inibitore della tirosin-chinasi, che potrebbe attenuare gli effetti regolatori negativi delle tirosin-chinasi su 2500003M10Rik, potenziandone così l'attività. | ||||||