La classe di sostanze chimiche nota come inibitori di PGC-1α comprende vari composti che possono modulare l'attività di PGC-1α in modo indiretto. Questa modulazione avviene attraverso l'influenza su altre proteine e vie di segnalazione che interagiscono con PGC-1α. Ad esempio, gli attivatori dell'AMPK come l'AICAR e la metformina possono fosforilare PGC-1α, influenzando le sue funzioni di coattivatore trascrizionale. Gli agonisti PPAR come GW501516, fenofibrato, pioglitazone e rosiglitazone possono alterare i livelli di espressione e l'attività di PGC-1α, influenzando così indirettamente le vie metaboliche in cui PGC-1α è coinvolto.
Inoltre, gli attivatori di SIRT1, come il resveratrolo, e gli inibitori come EX-527 possono influire sullo stato di acetilazione di PGC-1α, che è fondamentale per la sua attività e l'interazione con altri fattori di trascrizione. Questa modificazione post-traduzionale determina il ruolo di PGC-1α nella biogenesi mitocondriale e nel metabolismo ossidativo. La modulazione dell'attività di PGC-1α da parte di queste sostanze chimiche è significativa perché PGC-1α è un centro regolatore del metabolismo energetico, che controlla l'espressione di geni coinvolti nella funzione mitocondriale, nella gluconeogenesi e nell'ossidazione degli acidi grassi.
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