XRN1 CRISPR/Cas9 KO Plasmid (h): sc-401910

Übersicht

XRN1 kodiert eine hochkonservierte 5′→3′-Exoribonuklease, die den zytoplasmatischen mRNA-Umsatz antreibt, indem sie decappte Transkripte abbaut und RNA-Abbauintermediate beseitigt. Es ist ein zentraler Bestandteil der posttranskriptionellen Genregulation und verknüpft Decapping und exonukleolytischen Abbau mit Signalwegen, die mRNA-Überwachung, die Dynamik von Stressgranula und die angeborene Immunerkennung aberranter oder viraler RNAs steuern. Über seine Rolle in der RNA-Qualitätskontrolle und der Umgestaltung des Transkriptoms beeinflusst XRN1 zelluläre Antworten auf Stress und Infektionen sowie breitere Programme der Proliferation und Differenzierung. Eine Fehlregulation des RNA-Abbaus und eine beeinträchtigte XRN1-Aktivität wurden mit veränderter Interferon-Signalgebung, neuroentwicklungsbezogenen Phänotypen und krebsrelevanten Veränderungen in Genexpressionsnetzwerken in Verbindung gebracht.

Das XRN1 CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (h) ist ein Pool von Plasmiden, die für die gezielte Disruption des XRN1-Gens in human-Zelllinien entwickelt wurden. Jedes Plasmid koexprimiert eine einzigartige Single-Guide-RNA (sgRNA), die auf eine bestimmte Stelle innerhalb des XRN1-Gens abzielt, zusammen mit der Streptococcus pyogenes Cas9-Nuklease. Die Plasmide kodieren zudem für GFP, was die fluoreszente Identifizierung und Anreicherung erfolgreich transfizierter Zellen mittels Fluoreszenzmikroskopie oder Durchflusszytometrie ermöglicht.

Das Multi-Guide-Design erhöht die Wahrscheinlichkeit, dass Insertionen oder Deletionen (Indels) entstehen, die den offenen Leserahmen von XRN1 nach der Cas9-vermittelten Bildung von Doppelstrangbrüchen unterbrechen. Durch das CRISPR/Cas9-System verursachte DNA-Brüche werden über endogene NHEJ-Wege (Non-Homologous End Joining) repariert, was häufig zu Frameshift-Mutationen führt, die die XRN1-Proteinexpression aufheben.

Dieses CRISPR-Knockout-System ermöglicht die effiziente Erzeugung von XRN1-defizienten Zellmodellen zur Untersuchung der XRN1-Signalübertragung, für funktionelle Genomstudien, in der Krebsbiologieforschung sowie zur Bewertung therapeutischer Reaktionen in menschlichen Zelllinien.

Hauptmerkmale

• sgRNAs, die auf XRN1-Exone abzielen, die für die XRN1-Funktion entscheidend sind
  Ko-Expression von SpCas9 und sgRNA aus einem einzigen Plasmid zur vereinfachten Verabreichung
  GFP-Reporter zur Identifizierung transfizierter Zellen
  Pool von Plasmiden, die auf mehrere XRN1-Genomstellen abzielen, um die Knockout-Effizienz zu verbessern
  Kompatibel mit der Verabreichung durch Transfektion

Designvarianten

CRISPRs +/- HDRs

• gRNAs, die vom XRN1 CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (h) und vom XRN1 CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (h2) kodiert werden, zielen auf unterschiedliche Stellen innerhalb des XRN1-Lokus ab. Es kann ein oder beide Targeting-Designs verfügbar sein. Siehe „Verwandte Produkte“ für Verfügbarkeit.
  HDR-Donorkonstrukte, kodiert durch das XRN1 HDR-Plasmid (h) und XRN1 HDR-Plasmid (h2) kodiert, enthalten eine Puromycin-Resistenzkassette und einen RFP-Reporter, flankiert von XRN1-Homologiearmen, um die homologe Reparatur an definierten XRN1-Zielstellen entsprechend den CRISPR/Cas9-KO-Designs zu unterstützen. Die Verfügbarkeit von HDR-Donoren kann variieren. Siehe „Verwandte Produkte“ für Verfügbarkeit.

Nur für Forschungszwecke. Nicht für diagnostische oder therapeutische Zwecke bestimmt.