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Plasmide CRISPR/Cas9 KO VPS39 (h) | sc-404507 | 20 µg | $397.00 |
VPS39 code une sous-unité centrale du complexe d’arrimage HOPS, qui médie la fusion entre endosome tardif et lysosome ainsi qu’entre autophagosome et lysosome, soutenant la maturation endolysosomale et la dégradation des cargaisons. En coordonnant l’arrimage membranaire dépendant des GTPases Rab et la fusion pilotée par les protéines SNARE, VPS39 contribue à l’homéostasie lysosomale, au renouvellement des récepteurs et au flux de la macroautophagie. La perturbation des composants de HOPS dérègle le trafic vésiculaire et peut entraîner l’accumulation de matériel non dégradé, une signalisation endosomale altérée et des réponses au stress associées à des phénotypes de type neurodégénératif et de surcharge lysosomale. VPS39 est donc pertinent pour la recherche sur l’autophagie, la dynamique endolysosomale et les défauts de trafic intracellulaire liés aux maladies.
Le plasmide CRISPR/Cas9 KO VPS39 (h) est un ensemble de plasmides conçus pour la disruption ciblée du gène VPS39 dans les lignées cellulaires human. Chaque plasmide co-exprime un ARN guide unique (sgRNA) ciblant un site distinct au sein du VPS39, ainsi que la nucléase Cas9 de Streptococcus pyogenes. Les plasmides codent également pour la GFP, ce qui permet l'identification par fluorescence et l'enrichissement des cellules transfectées avec succès par microscopie à fluorescence ou cytométrie en flux.
La conception multi-guide augmente la probabilité de générer des insertions ou des délétions (indels) qui perturbent le cadre de lecture ouvert VPS39 à la suite de la formation de cassures double brin médiées par Cas9. Les cassures d'ADN introduites par le système CRISPR/Cas9 sont réparées par des voies endogènes de jonction non homologue (NHEJ), ce qui entraîne fréquemment des mutations par décalage du cadre de lecture qui suppriment l'expression de la protéine VPS39.
Ce système de knock-out CRISPR permet la génération efficace de modèles cellulaires déficients en VPS39 pour l'étude de la signalisation de VPS39, les études de génomique fonctionnelle, la recherche en biologie du cancer et l'évaluation des réponses thérapeutiques dans des lignées cellulaires humaines.
CRISPR +/- HDR
Réservé à la recherche. N'est pas destiné à un usage diagnostique ou thérapeutique.