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V-ATPase C1 CRISPR Activationプラスミド (h) | sc-402679-ACT | 20 µg | $397.00 |
ATP6V1C1は、液胞型H⁺-ATPアーゼ(V-ATPase)のV1周辺ドメインを構成するC1サブユニットをコードする。V-ATPaseはATP依存性のプロトンポンプであり、エンドソーム、リソソーム、分泌小胞を酸性化する。オルガネラの酸性化を支えることで、V-ATPase C1は受容体介在性エンドサイトーシス、オートファジー・フラックス、リソソーム酵素活性、ならびにリソソーム膜上でのmTORC1の栄養感知シグナル伝達に寄与する。V-ATPase機能の変化は、細胞内pH恒常性、小胞輸送、プロテオスタシスを乱し得るが、これらの過程は神経変性、がん細胞代謝、免疫細胞活性化といった文脈でしばしば研究対象となる。そのためATP6V1C1は、オルガネラ酸性化とシグナル伝達、ならびに細胞ストレス応答を結び付ける経路を解明するうえで有用なノードである。
V-ATPase C1 CRISPR活性化プラスミド(h)は、基盤となるDNA配列を変更することなく、内因性ATP6V1C1の発現を標的化し、非破壊的にアップレギュレートするアプローチを提供します。
V-ATPase C1 CRISPR 活性化プラスミド (h) は、ヒト細胞株における ATP6V1C1 遺伝子座の高効率かつ部位特異的な転写アップレギュレーションのために設計された、3 つのプラスミドからなる相乗的活性化メディエーター (SAM) システムです。このシステムは、DNA結合能を維持しつつヌクレアーゼ活性を失わせる2つの不活性化変異(D10AおよびN863A)を有する、触媒活性のないCas9(dCas9)を中核としています。このdCas9は、強力な転写活性化因子であるVP64と融合しており、選別用のブラスティシジン耐性遺伝子と共に共発現します。2番目のプラスミドは、dCas9-VP64と協調して機能する二次活性化複合体であるMS2-p65-HSF1融合タンパク質をコードしており、ヒグロマイシン耐性遺伝子と共に発現する。3番目のプラスミドは、標的特異的な20塩基対のsgRNAをコードしており、これはMS2-p65-HSF1複合体を活性化部位に誘導する2つのMS2 RNAアプタマーと融合しており、さらにピューロマイシン耐性遺伝子が付随している。これら3つのプラスミドは、システム構成要素すべてが均等に発現するよう、質量比1:1:1で導入される。
標的遺伝子座に集合すると、SAM複合体はATP6V1C1転写開始点の上流約200 bpの領域に結合し、そこでVP64、p65、およびHSF1が協調して転写装置を動員し、内因性V-ATPase C1の発現上昇を促進する。ヌクレアーゼ活性を持つCas9とは異なり、 dCas9は二本鎖切断を導入したりゲノム配列を改変したりしないため、天然のATP6V1C1遺伝子座が保持され、内因性遺伝子座におけるV-ATPase C1依存性の転写応答の研究が可能となります。これにより、機能解析、標的遺伝子の同定、およびATP6V1C1発現が沈黙または低下した腫瘍細胞におけるV-ATPase C1経路の回復のモデル化を行う上で、貴重なツールとなります。
研究用のみ。診断用または治療用ではありません。