TNFα-IP 2 Plasmide KO CRISPR/Cas9 (m): sc-423435

Panoramica

Tnfaip2 codifica per la proteina 2 indotta dal TNFα (TNFα-IP 2), un fattore responsivo alle citochine implicato nella segnalazione infiammatoria e nel rimodellamento del comportamento cellulare durante l’attivazione immunitaria. La sua espressione è indotta a valle di TNFα/NF-κB e di vie correlate, ed è stata collegata alla regolazione della dinamica del citoscheletro, del traffico di membrana e della migrazione in contesti mieloidi ed endoteliali. Nei modelli murini, TNFα-IP 2 è spesso utilizzata come indicatore dei programmi trascrizionali pro-infiammatori e come nodo di connessione tra segnali dell’immunità innata e cambiamenti di adesione e motilità. Una disregolazione della segnalazione associata a TNFα-IP 2 è stata studiata nel contesto dell’infiammazione cronica e della biologia del microambiente associato ai tumori, a supporto della sua utilità nel dissezionare il crosstalk infiammazione–cancro senza implicare esiti clinici.

Il plasmide CRISPR/Cas9 KO TNFα-IP 2 (m) è un pool di plasmidi progettato per la distruzione mirata del gene Tnfaip2 in linee cellulari mouse. Ciascun plasmide co-esprime un singolo RNA guida (sgRNA) unico che prende di mira un sito distinto all'interno del Tnfaip2 insieme alla nucleasi Cas9 di Streptococcus pyogenes. I plasmidi codificano anche per la GFP, consentendo l'identificazione fluorescente e l'arricchimento delle cellule trasfettate con successo tramite microscopia a fluorescenza o citometria a flusso.

Il design multi-guida aumenta la probabilità di generare inserzioni o delezioni (indels) che interrompono il frame di lettura aperto Tnfaip2 a seguito della formazione di rotture a doppio filamento mediate da Cas9. Le rotture del DNA introdotte dal sistema CRISPR/Cas9 vengono riparate attraverso vie endogene di giunzione non omologa (NHEJ), che spesso provocano mutazioni con spostamento del frame che annullano l'espressione della proteina TNFα-IP 2.

Questo sistema di knockout CRISPR consente la generazione efficiente di modelli cellulari carenti di Tnfaip2 per lo studio della segnalazione di TNFα-IP 2, studi di genomica funzionale, ricerca sulla biologia del cancro e valutazione delle risposte terapeutiche in linee cellulari umane.

Caratteristiche principali

• sgRNA mirati agli esoni Tnfaip2 critici per la funzione di TNFα-IP 2
  Co-espressione di SpCas9 e sgRNA da un singolo plasmide per una somministrazione semplificata
  Reporter GFP per l'identificazione delle cellule trasfettate
  Pool di plasmidi mirati a più siti genomici di Tnfaip2 per migliorare l'efficienza del knockout
  Compatibile con la somministrazione tramite trasfezione

Varianti di progettazione

CRISPR +/- HDR

• Gli gRNA codificati dal TNFα-IP 2 CRISPR/Cas9 KO Plasmid (m) e dal TNFα-IP 2 CRISPR/Cas9 KO Plasmid (m2) prendono di mira siti distinti all'interno del locus Tnfaip2. Potrebbe essere disponibile uno o entrambi i design di targeting. Vedere Prodotti correlati per la disponibilità.
  I costrutti donatori HDR codificati dal TNFα-IP 2 Plasmide HDR (m) e il plasmide HDR TNFα-IP 2 (m2) contengono una cassetta di resistenza alla puromicina e un reporter RFP affiancato da bracci di omologia Tnfaip2 per supportare la riparazione diretta dall'omologia in siti bersaglio Tnfaip2 definiti corrispondenti ai disegni CRISPR/Cas9 KO. La disponibilità dei donatori HDR può variare. Vedere Prodotti correlati per la disponibilità.

Solo per uso di ricerca. Non destinato a uso diagnostico o terapeutico.