Suc-LLVY-AMC

Suc-LLVY-AMC est un substrat fluorogène sensible pour le protéasome 20S, les calpaïnes et d'autres protéases de type chymotrypsine. Le substrat non fluorescent génère un produit AMC fluorescent bleu vif qui a Ex/Em = 351/430 nm et peut être facilement détecté avec le jeu de filtres DAPI. La forme la plus courante du protéasome est connue sous le nom de protéasome 26S qui contient une structure de particules centrales 20S et deux capuchons régulateurs 19S. Toutes les particules 20S sont constituées de quatre structures d'anneaux heptamériques empilées qui sont elles-mêmes composées de deux types différents de sous-unités: les sous-unités alpha sont de nature structurelle, tandis que les sous-unités bêta sont principalement catalytiques. Les deux anneaux extérieurs de l'empilement sont constitués chacun de sept sous-unités alpha, qui servent de domaines d'amarrage pour les particules régulatrices, et les extrémités N des sous-unités alpha forment une porte qui bloque l'accès non régulé des substrats à la cavité intérieure. Les deux anneaux intérieurs sont constitués chacun de sept sous-unités bêta et contiennent les sites actifs des protéases qui effectuent les réactions de protéolyse. Suc-LLVY-AMC est un substrat peptidique synthétique utilisé dans les essais biochimiques et enzymatiques pour mesurer l'activité des enzymes du protéasome. Le nom « Suc-LLVY-AMC » signifie Succinyl-Leu-Leu-Val-Tyr-7-amino-4-méthylcoumarine, ce qui représente la séquence et la structure du substrat.