Plasmide CRISPR/Cas9 KO Sox-21 (h): sc-406354

Présentation

SOX21 code le facteur de transcription Sox-21, une protéine de liaison à l’ADN de type boîte HMG (high-mobility group) qui régule l’engagement de lignée et les programmes de différenciation dans les tissus ectodermiques et neuraux. Sox-21 participe à des réseaux transcriptionnels qui recoupent les voies de signalisation Notch et Wnt, et peut moduler l’équilibre entre le maintien des progéniteurs et la maturation neuronale via une répression ou une activation génique dépendante du contexte. Au cours du développement, il contribue à la spécification du destin cellulaire et à la mise en place des patrons tissulaires, ce qui en fait un nœud pertinent pour étudier le contrôle transcriptionnel de la neurogenèse et de la différenciation épidermique. Une expression dérégulée de SOX21 a été rapportée dans plusieurs types de tumeurs ainsi que dans des états de différenciation anormaux, ce qui motive l’étude de ses rôles dans les programmes transcriptionnels oncogéniques et les transitions d’état cellulaire.

Le plasmide CRISPR/Cas9 KO Sox-21 (h) est un ensemble de plasmides conçus pour la disruption ciblée du gène SOX21 dans les lignées cellulaires human. Chaque plasmide co-exprime un ARN guide unique (sgRNA) ciblant un site distinct au sein du SOX21, ainsi que la nucléase Cas9 de Streptococcus pyogenes. Les plasmides codent également pour la GFP, ce qui permet l'identification par fluorescence et l'enrichissement des cellules transfectées avec succès par microscopie à fluorescence ou cytométrie en flux.

La conception multi-guide augmente la probabilité de générer des insertions ou des délétions (indels) qui perturbent le cadre de lecture ouvert SOX21 à la suite de la formation de cassures double brin médiées par Cas9. Les cassures d'ADN introduites par le système CRISPR/Cas9 sont réparées par des voies endogènes de jonction non homologue (NHEJ), ce qui entraîne fréquemment des mutations par décalage du cadre de lecture qui suppriment l'expression de la protéine Sox-21.

Ce système de knock-out CRISPR permet la génération efficace de modèles cellulaires déficients en SOX21 pour l'étude de la signalisation de Sox-21, les études de génomique fonctionnelle, la recherche en biologie du cancer et l'évaluation des réponses thérapeutiques dans des lignées cellulaires humaines.

Caractéristiques principales

• sgRNA ciblant le ou les exons de SOX21 essentiels à la fonction de Sox-21
  Co-expression de SpCas9 et de sgRNA à partir d'un seul plasmide pour une administration simplifiée
  Rapporteur GFP pour l'identification des cellules transfectées
  Pool de plasmides ciblant plusieurs sites génomiques de SOX21 pour améliorer l'efficacité du knock-out
  Compatible avec l'administration par transfection

Variantes de conception

CRISPR +/- HDR

• Les gRNA codés par le Sox-21 plasmide CRISPR/Cas9 KO (h) et le Sox-21 plasmide CRISPR/Cas9 KO (h2) ciblent des sites distincts au sein du locus SOX21. Une ou les deux conceptions de ciblage peuvent être disponibles. Voir les produits associés pour connaître la disponibilité.
  Les constructions donneuses HDR codées par le Sox-21 plasmide HDR (h) et le Sox-21 (h2) contiennent une cassette de résistance à la puromycine et un rapporteur RFP flanqué de bras d'homologie SOX21 pour permettre la réparation dirigée par homologie au niveau de sites cibles SOX21 définis correspondant aux conceptions CRISPR/Cas9 KO. La disponibilité des donneurs HDR peut varier. Voir les produits associés pour connaître la disponibilité.

Réservé à la recherche. N'est pas destiné à un usage diagnostique ou thérapeutique.