Plasmide CRISPR/Cas9 KO Sox-13 (h): sc-409568

Présentation

SOX13 code Sox-13, un facteur de transcription à domaine HMG (high-mobility group) de la famille SOX, qui se lie à l’ADN pour moduler des programmes d’expression génique spécifiques de lignée. Sox-13 participe à des processus de développement et de différenciation, notamment via la régulation de réseaux transcriptionnels qui orientent les décisions de destinée cellulaire et l’expression de gènes liés à l’immunité. Dans les cellules humaines, l’activité de SOX13 est associée à des voies impliquées dans le contrôle transcriptionnel et la régulation dépendante de la chromatine, avec des liens rapportés, dans certains contextes, à une dérégulation immunitaire et à des états transcriptionnels associés au cancer. L’étude de la fonction de SOX13 aide à préciser comment les facteurs de la famille SOX coordonnent des circuits de régulation génique influençant la prolifération, la différenciation et la transcription en réponse au stress.

Le plasmide CRISPR/Cas9 KO Sox-13 (h) est un ensemble de plasmides conçus pour la disruption ciblée du gène SOX13 dans les lignées cellulaires human. Chaque plasmide co-exprime un ARN guide unique (sgRNA) ciblant un site distinct au sein du SOX13, ainsi que la nucléase Cas9 de Streptococcus pyogenes. Les plasmides codent également pour la GFP, ce qui permet l'identification par fluorescence et l'enrichissement des cellules transfectées avec succès par microscopie à fluorescence ou cytométrie en flux.

La conception multi-guide augmente la probabilité de générer des insertions ou des délétions (indels) qui perturbent le cadre de lecture ouvert SOX13 à la suite de la formation de cassures double brin médiées par Cas9. Les cassures d'ADN introduites par le système CRISPR/Cas9 sont réparées par des voies endogènes de jonction non homologue (NHEJ), ce qui entraîne fréquemment des mutations par décalage du cadre de lecture qui suppriment l'expression de la protéine Sox-13.

Ce système de knock-out CRISPR permet la génération efficace de modèles cellulaires déficients en SOX13 pour l'étude de la signalisation de Sox-13, les études de génomique fonctionnelle, la recherche en biologie du cancer et l'évaluation des réponses thérapeutiques dans des lignées cellulaires humaines.

Caractéristiques principales

• sgRNA ciblant le ou les exons de SOX13 essentiels à la fonction de Sox-13
  Co-expression de SpCas9 et de sgRNA à partir d'un seul plasmide pour une administration simplifiée
  Rapporteur GFP pour l'identification des cellules transfectées
  Pool de plasmides ciblant plusieurs sites génomiques de SOX13 pour améliorer l'efficacité du knock-out
  Compatible avec l'administration par transfection

Variantes de conception

CRISPR +/- HDR

• Les gRNA codés par le Sox-13 plasmide CRISPR/Cas9 KO (h) et le Sox-13 plasmide CRISPR/Cas9 KO (h2) ciblent des sites distincts au sein du locus SOX13. Une ou les deux conceptions de ciblage peuvent être disponibles. Voir les produits associés pour connaître la disponibilité.
  Les constructions donneuses HDR codées par le Sox-13 plasmide HDR (h) et le Sox-13 (h2) contiennent une cassette de résistance à la puromycine et un rapporteur RFP flanqué de bras d'homologie SOX13 pour permettre la réparation dirigée par homologie au niveau de sites cibles SOX13 définis correspondant aux conceptions CRISPR/Cas9 KO. La disponibilité des donneurs HDR peut varier. Voir les produits associés pour connaître la disponibilité.

Réservé à la recherche. N'est pas destiné à un usage diagnostique ou thérapeutique.