Plasmide CRISPR/Cas9 KO SOCS-6 (h): sc-402344

Présentation

SOCS6 code le suppresseur de la signalisation des cytokines 6 (SOCS-6), un membre de la famille SOCS qui atténue la signalisation des récepteurs et des cytokines via son domaine SH2 et le recrutement, dépendant de la SOCS box, de complexes de ligase de l’ubiquitine. SOCS-6 participe à la régulation négative des voies JAK/STAT et des récepteurs à activité tyrosine kinase, influençant en aval les sorties de signalisation PI3K–AKT et MAPK qui contrôlent la prolifération, la différenciation et la survie. En modulant la durée des signaux et en favorisant le renouvellement des composants de signalisation activés, SOCS-6 contribue au maintien de l’homéostasie cellulaire dans des contextes immunitaires et sensibles aux facteurs de croissance. Une expression ou une fonction altérée de SOCS6 a été associée à des réseaux de signalisation dérégulés impliqués dans la transformation oncogénique et des phénotypes liés à l’immunité, ce qui en fait une cible pertinente pour des études mécanistiques sur la rétroaction des voies et la terminaison des signaux.

Le plasmide CRISPR/Cas9 KO SOCS-6 (h) est un ensemble de plasmides conçus pour la disruption ciblée du gène SOCS6 dans les lignées cellulaires human. Chaque plasmide co-exprime un ARN guide unique (sgRNA) ciblant un site distinct au sein du SOCS6, ainsi que la nucléase Cas9 de Streptococcus pyogenes. Les plasmides codent également pour la GFP, ce qui permet l'identification par fluorescence et l'enrichissement des cellules transfectées avec succès par microscopie à fluorescence ou cytométrie en flux.

La conception multi-guide augmente la probabilité de générer des insertions ou des délétions (indels) qui perturbent le cadre de lecture ouvert SOCS6 à la suite de la formation de cassures double brin médiées par Cas9. Les cassures d'ADN introduites par le système CRISPR/Cas9 sont réparées par des voies endogènes de jonction non homologue (NHEJ), ce qui entraîne fréquemment des mutations par décalage du cadre de lecture qui suppriment l'expression de la protéine SOCS-6.

Ce système de knock-out CRISPR permet la génération efficace de modèles cellulaires déficients en SOCS6 pour l'étude de la signalisation de SOCS-6, les études de génomique fonctionnelle, la recherche en biologie du cancer et l'évaluation des réponses thérapeutiques dans des lignées cellulaires humaines.

Caractéristiques principales

• sgRNA ciblant le ou les exons de SOCS6 essentiels à la fonction de SOCS-6
  Co-expression de SpCas9 et de sgRNA à partir d'un seul plasmide pour une administration simplifiée
  Rapporteur GFP pour l'identification des cellules transfectées
  Pool de plasmides ciblant plusieurs sites génomiques de SOCS6 pour améliorer l'efficacité du knock-out
  Compatible avec l'administration par transfection

Variantes de conception

CRISPR +/- HDR

• Les gRNA codés par le SOCS-6 plasmide CRISPR/Cas9 KO (h) et le SOCS-6 plasmide CRISPR/Cas9 KO (h2) ciblent des sites distincts au sein du locus SOCS6. Une ou les deux conceptions de ciblage peuvent être disponibles. Voir les produits associés pour connaître la disponibilité.
  Les constructions donneuses HDR codées par le SOCS-6 plasmide HDR (h) et le SOCS-6 (h2) contiennent une cassette de résistance à la puromycine et un rapporteur RFP flanqué de bras d'homologie SOCS6 pour permettre la réparation dirigée par homologie au niveau de sites cibles SOCS6 définis correspondant aux conceptions CRISPR/Cas9 KO. La disponibilité des donneurs HDR peut varier. Voir les produits associés pour connaître la disponibilité.

Réservé à la recherche. N'est pas destiné à un usage diagnostique ou thérapeutique.